dc.contributor
Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.contributor.author
Meer, Margarita V.
dc.date.accessioned
2017-04-10T10:08:12Z
dc.date.available
2017-04-10T10:08:12Z
dc.date.issued
2015-12-09
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/10803/402192
dc.description.abstract
Fitness landscape is a concept, which describes the dependence of phenotype on
genotype. It was proposed almost a hundred years ago but only recent burst of
technologies finally allowed exploring it. We studied different aspects of fitness
landscape applying both: computational and experimental approaches. Using
mammalian mitochondrial tRNAs we proved that evolution can proceed not only along
the ridges of high fitness but also cross the low fitness valleys. Functional analysis of
more than 56 000 mutants of green fluorescent protein from Aequorea victoria (avGFP)
allowed us to describe local fitness landscape around a particular fitness peak. In
addition to this we studied a case of population being on a slope – genetic code is
undergoing changes in Methanosarcina making them stay in sub-optimum.
en_US
dc.description.abstract
El paisaje adaptativo (fitness landscape) es un concepto que describe la dependencia del
fenotipo en el genotipo. Hace mas de cien años que éste concepto fue propuesto, pero es
sólo con la reciente expansión de tecnologías que finalmente ha podido ser explorado.
Hemos estudiado diferentes aspectos del paisaje adaptativo aplicando tanto
procedimientos computacionales como experimentales. Utilizando tRNAs
mitocondriales de mamíferos hemos comprobado que la evolución puede proceder no
sólo a lo largo de las crestas de elevado fitness sino también a través de los valles con
reducido fitness. Análisis funcional de mas de 56000 mutantes de la proteína verde
fuorescente de Aequorea Victoria (avGFP) nos permitió describir el paisaje adaptativo
local alrededor de un punto máximo específico de fitness. Mas aún, hemos estudiado un
caso de una población en una pendiente – el código genético está atravesando cambios
en Methanosarcina quedándose en sub-óptimo.
en_US
dc.format.extent
134 p.
en_US
dc.format.mimetype
application/pdf
dc.language.iso
eng
en_US
dc.publisher
Universitat Pompeu Fabra
dc.rights.license
ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.source
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject
Fitness landscape
en_US
dc.subject
Molecular evolution
en_US
dc.subject
Paisaje adaptativo
en_US
dc.subject
Evolución molecular
en_US
dc.title
Exploring fitness landscapes
en_US
dc.type
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.contributor.authoremail
gr.meer@gmail.com
en_US
dc.contributor.director
Kondrashov, Fyodor A.
dc.embargo.terms
cap
en_US
dc.rights.accessLevel
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.description.degree
Programa de doctorat en Biomedicina
