dc.contributor
Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.contributor.author
Espeso Gil, Sergio
dc.date.accessioned
2018-05-15T15:43:17Z
dc.date.available
2018-05-15T15:43:17Z
dc.date.issued
2016-12-05
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/10803/552941
dc.description.abstract
El reguloma està constituït per un sistema complex de factors que controlen el fenotip molecular de la cèl·lula, que al seu torn està influenciada pel medi ambient. Qualsevol pertorbació pot desencadenar canvis que poden implicar una regulació disfuncional. El cervell integra constantment una quantitat considerable d’informació motora, sensorial i cognitiva. Aquesta integració és particularment important en el desenvolupament postnatal, en què el cervell ha d'establir els compromisos moleculars necessaris per adaptar-se a un entorn canviant. L'objectiu d'aquest estudi és investigar com els factors ambientals poden influenciar en el reguloma de l'escorça cerebral durant el desenvolupament postnatal. Per tal d'estudiar la interacció entre el reguloma i el medi ambient, s’ha utilitzat el paradigma d'enriquiment ambiental en què s’exposa els ratolins a estímuls freqüentment canviants de manera constant durant un mes. En aquest estudi s'ha emprat seqüenciació d'última generació per poder analitzar l'epigenoma, regions obertes de la cromatina, interaccions cromosòmiques, el transcriptoma i el proteoma. En particular, s’observen canvis dinàmics en la cobertura de la modificació H3K79me2 neuronal, juntament amb un augment general d'accessibilitat en regions promotores i enhancers associats a gens importants per a l'aprenentatge. Complementàriament, les dades de transcriptòmica i proteòmica recolzen aquests resultats. Així mateix, s’ha implementat una estratègia particular en citometria de flux que ha permès esbrinar quines són les majors diferències en els canvis induïts per l'enriquiment ambiental en l'escorça cerebral i neurones corticals. En conjunt, i per primer cop, aquests estudis apunten que l'enriquiment ambiental indueix una sèrie de canvis en els mecanismes de regulació de les neurones corticals, relacionats amb un minuciós ajust sinàptic durant el desenvolupament postnatal.
en_US
dc.description.abstract
The regulome constitutes a complex system of factors that control the molecular
phenotype of the cell, which is influenced by the environment. Any disturbance can
trigger a set of changes involving dysfunctional regulation. The brain constantly
integrates a multitude of motor, sensory and cognitive information. This engagement is
particularly important in postnatal development when the brain must establish the
molecular commitments needed to adapt to a changing environment. The aim of this
study is to investigate how environmental factors influence the cerebral cortex regulome
during postnatal development. In order to study the interaction between the regulome
and the environment, we used the paradigm of environmental enrichment (EE) in which
mice received constant and novel stimulation during a month. Next Generation
Sequencing (NGS) –based techniques were employed to analyze the epigenome, gene
accessibility, chromosomal interactions, the transcriptome and the proteome. Notably,
dynamic changes in neuronal H3K79me2 coverage were observed, together with a
general gain of promoter and enhancer accessibility of learning-associated genes. These
changes were also supported by transcriptomic and proteomic data. We followed a flow
cytometry strategy that allowed us to highlight differences in EE-induced changes in the
cerebral cortex and cortical neurons. Our research reveals for the first time that EE
induces changes in the regulatory mechanisms related with synaptic fine-tuning in
cortical neurons during postnatal development.
en_US
dc.format.extent
155 p.
en_US
dc.format.mimetype
application/pdf
dc.language.iso
eng
en_US
dc.publisher
Universitat Pompeu Fabra
dc.rights.license
ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.source
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject
Enriquecimiento ambiental
en_US
dc.subject
Epigenética
en_US
dc.subject
H3K79me2
en_US
dc.subject
Reguloma
en_US
dc.subject
Environmental enrichment
en_US
dc.subject
Epigenetics
en_US
dc.subject
Regulome
en_US
dc.title
The mouse cortex regulome. Effects of environmental enrichment on postnatal brain development
en_US
dc.type
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.contributor.authoremail
sergio.espeso@crg.eu
en_US
dc.contributor.director
Ossowski, Stephan
dc.embargo.terms
12 mesos
en_US
dc.rights.accessLevel
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.description.degree
Programa de doctorat en Biomedicina