Paper dels receptors de les cèl·lules Natural Killer i dels seus lligands, estudiats mitjançant tecnologia NGS, en l’evolució de pacients amb neoplàsies mieloides

Abstract

La present tesi doctoral consta d’una primera part de disseny i desenvolupament d’una nova metodologia per dur a terme la seqüenciació de gens codificants de receptors de les cèl·lules NK i dels seus respectius lligands més polimòrfics. S’ha demostrat la gran eficàcia de la tecnologia NGS a l’hora d’obtenir els tipatges d’aquests gens en comparació amb les alternatives que es trobaven vigents a l’inici d’aquest treball. A la vegada, ha quedat palès que el factor limitant d’aquest tipus d’estratègies es troba en les eines disponibles per dur a terme l’anàlisi de les dades, fet que ens porta a seguir comparant nous programaris que van apareixent per posar a punt el tipatge KIR a resolució al·lèlica. La validació d’aquest mètode no només ha permès dur a terme la segona part d’aquest treball, sinó que també ha permès implementar l’estratègia a l’activitat assistencial del Laboratori d’Histocompatibilitat i Immunogenètica del BST. La segona part de la present tesi es basa en l’aplicació de l’estratègia desenvolupada en un estudi clínic retrospectiu on s’estudia la possible implicació de les variants dels receptors de les cèl·lules NK i dels seus lligands en la resposta de pacients amb CML als tractaments ITC. Per dur-ho a terme, s’ha estudiat la distribució dels polimorfismes d’aquests gens a la nostra població així com a un grup de 190 pacients. Finalment, s’ha acceptat la hipòtesi plantejada a l’inici d’aquest projecte, la qual afirmava que pacients amb CML i amb perfils NK amb receptors activadors presenten més bona resposta als tracta i dels seus lligands en la resposta de pacients amb CML als tractaments ITC. Per dur-ho a terme, s’ha estudiat la distribució dels polimorfismes d’aquests gens a la nostra població així com a un grup de 190 pacients. Finalment, s’ha acceptat la hipòtesi plantejada a l’inici d’aquest projecte, la qual afirmava que pacients amb CML i amb perfils NK amb receptors activadors presenten més bona resposta als tractaments ITC.

The present doctoral thesis consists of a first part of the design and development of a new methodology to carry out the sequencing of NK cell receptor coding genes and their respective more polymorphic ligands. It has been demonstrated the great efficiency of NGS technology in obtaining the types of these genes in comparison with the alternatives that were in force at the beginning of this work. At the same time, it has become clear that the limiting factor of this type of strategy lies in the tools available to carry out the data analysis, a fact that leads us to continue comparing new programs that have been appearing to develop the KIR type at allele resolution. The validation of this method has not only allowed us to carry out the second part of this project, but has also allowed us to implement the strategy in the assistance activity of the Laboratory of Histocompatibility and Immunogenetics of the BST. The second part of the present thesis is based on the application of the strategy developed in a retrospective clinical study on the possible implication of NK cell receptor variants and their ligands in the response of patients with CML to ITC treatments. To do so, we studied the distribution of polymorphisms of these genes in our population as well as in a group of 190 patients. Finally, the hypothesis put forward at the beginning of this project was accepted, which stated that patients with CML and NK profiles with activating receptors have a better response to treatment and its links in the response of patients with CML to ITC treatments. To do so, we studied the distribution of polymorphisms of these genes in our population as well as in a group of 190 patients. Finally, the hypothesis put forward at the beginning of this project was accepted, which stated that patients with CML and NK profiles with activating receptors have a better response to ITC treatments.