Bonobo evolution : from the perspective of genomes

Abstract

Bonobos are an interesting species to study due to their unique evolutionary features such as a peaceful social nature and hypersexual behavior. The prolonged exaggerated sexual swelling in females is a notable difference to chimpanzees, from which they diverged < 2 Million years ago. In my studies, I first show using whole-exomes, that there is genetic population substructure in bonobos. I estimate that the split between the western and the central bonobo population might be >100,000 years ago, comparable to modern human population split times. Second, I show that lineage-specific non-synonymous derived alleles in bonobos are enriched in genes associated with ‘age at menarche’, which suggests that the differences between bonobo and chimpanzee females in their exaggerated sexual swellings might be due to unique genetic changes in bonobos since their divergence. Finally, I show, across bonobos and four chimpanzee subspecies, that the efficacy of purifying selection correlates with effective population size, with bonobos and western chimpanzees showing similar levels.

El bonobo és una espècie d’especial interès per les seves característiques evolutives úniques: la seva naturalesa pacífica i social, i el seu comportament hipersexual. La principal diferència amb els ximpanzés, que van divergir dels bonobos fa 2 milions d’anys, és el llarg període d’inflor sexual exagerada en les femelles. En la recerca presentada en aquesta tesi, en primer lloc he demostrat que hi ha estructura poblacional genètica en bonobos, utilitzant dades d’exomes sencers. Alhora, he estimat que la separació entre els bonobos occidentals i centrals va ocórrer fa >100.000 anys, una data comparable amb la divergència amb els humans. En segon lloc, he examinat com els al·lels derivats no sinònims i específics de llinatge en bonobos estan enriquits en gens associats a “l’edat de menarquia”. Això suggereix que les clares diferències en la inflor sexual exagerada entre bonobos i ximpanzés poden ser degudes a la l’evolució privada dels bonobos des de la seva divergència amb els ximpanzés. Finalment, he mostrat com l’eficàcia de la selecció purificadora correlaciona amb la mida poblacional efectiva tant amb bonobos com en els quatre llinatges de ximpanzés, sent els bonobos i els ximpanzés occidentals molt similars entre ells.