Study of cell response over nanopatterned ligands on diblock copolymer surfaces

Abstract

Cells in tissues are exposed to extracellular signals that integrate and appropriately translate into specific responses. Receptors at the cell membrane recognize a variety of soluble ligands, extracellular matrix proteins and molecules presented by the neighboring cells. Ligand-receptor recognition event triggers intracellular signal transduction pathways modulating the resulting cell function. Some receptors do not function individually as signaling units but require interactions and associations with other receptors in multimolecular complexes. This process is known as receptor clustering and is an evolutionarily preserved mechanism responsible for the integration of highly complex signals. Increasing evidences suggest that this exceptional integration is subjected to spatially controlled ligand distribution at the nanoscale. Recent developments in highly sophisticated nanofabrication approaches have allowed to experimentally address this detailed spatial regulation on cell signaling. However, it is still unclear how the nanoscale distribution of ligands can impact on the dynamics of receptor activation and signaling processes.

Herein we present a nanostructured platform to create patterns of ligands in regular nanosized (< 30 nm) clusters. We based our platform in self-assembled diblock copolymers composed of poly(styrene) (PS) and poly(methyl methacrylate) (PMMA) that tend to segregate into nanodomains. The hexagonal arrangement of the PMMA domains acts as template to be replicated by the ligand distribution. Thanks to the versatile functionalization strategy developed, any amine-bearing molecule can be covalently immobilized. The spatial distribution of ligand was analyzed by Atomic force microscopy (AFM) and stochastic reconstruction microscopy (STORM), unveiling the high level of fidelity between the nanopatterned ligands and the underlying polymeric template.

To validate these substrates as platforms for systematic study of receptor clustering processes, an adhesive peptide which promotes focal adhesion formation, was immobilized on the nanopatterned surfaces. While the overall ligand surface density was maintained constant, the spatial distribution of ligands showed a remarkable impact on focal adhesion formation. Cells on nanopatterns showed an increased number of focal contacts, which were, in turn, more matured than those found in cells cultured on randomly presenting ligands. These findings suggest that ligand presentation in a clustered format might promote multivalent ligand-receptor interactions which can help to shed light on receptor oligomerization processes.

In addition, the nanopatterned substrates developed were used to investigate the dynamics of the process of Eph receptor assembly into oligomeric clusters upon stimulation with ephrin ligands. It is known that Eph receptor oligomer composition is crucial in the fine-tuning of receptor signaling, as it will trigger intracellular signals feedback which will modulate cell response. Oligomerization processes, which imply resolving the temporal evolution of nanometric size objects in diffusive environments such as cell membranes are beyond the reach of live-imaging tools. We in here resolve the oligomerization kinetics of the Eph receptor in live cells with the required spatial and temporal resolution by using an enhanced version of the Number and Brightness (eN&B) technique, which can discriminate with molecular sensitivity the oligomeric species. The results demonstrated that stimulation through surface-bound ligands with a random distribution was not sufficient to activate the receptor signaling. Conversely, when nanopatterned on our substrates, ligands effectively induced receptor oligomerization. In addition, surface-induced ligand clustering by our nanopatterning approach accelerated the dynamics of receptor oligomerization process when compared to antibody-induced ligand clustering. Such an efficiency was induced even when ligand surface coverage was 9-fold lower in the nanopatterned presentation. Therefore, our ligand presenting platform is thought to induce multivalent ligand-receptor interactions, and might be a useful strategy to precisely tune and potentiate receptor responses. It has promising applications in biotechnology and biomedicine, such as cell culture systems to provide insight into relevant receptor clustering processes and design of new bioactive materials and drug-delivery systems.

En los tejidos, las células reciben múltiples señales tanto de naturaleza física como química del entorno que las rodea. Inmersas en un entorno tridimensional, las células interactúan entre sí y con la matriz proteica que las envuelve. Además, hasta ellas difunden diversos factores solubles que transmiten señales químicas revelantes implicadas en el correcto funcionamiento celular. Ante tan complejo entorno, las células son capaces de reconocer de manera diferencial los estímulos que reciben y responder a todos ellos a través de complejos mecanismos intracelulares de señalización.

Recientemente, se han desarrollado herramientas altamente sofisticadas que permiten estudiar el comportamiento celular ante una presentación definida de ligandos. Se ha demostrado que fenómenos tan relevantes como la adhesión, la proliferación o la diferenciación celular son sensibles a la distribución espacial nanométrica de ligandos en superficie. Múltiples receptores celulares, cuando son estimulados por sus correspondientes ligandos, necesitan agruparse y formar clústers que modulan la transmisión de la señal. Desafortunadamente, todavía se desconocen los pormenores de la activación y la dinámica de agregación de los mismos ante las múltiples combinaciones espaciales de ligandos.

Por este motivo, este trabajo tiene como objetivo el desarrollo de superficies que permitan la presentación controlada de ligandos en grupos nanométricos para analizar el efecto de los mismos en los procesos de señalización intracelular. Para abordar este ambicioso objetivo, se desarrolló una plataforma a partir de copolímeros en bloque cuya principal particularidad es que se autoensamblan, generando estructuras nanométricas. El copolímero en bloque más utilizado en este ámbito es el compuesto por poliestireno y poli(metil metacrilato) (PS-b-PMMA). En este estudio se utilizaron dos copolímeros en bloque con distinta fracción volumétrica de cada uno de los componentes, de manera que se autoensamblan generando cilindros nanométricos de PMMA inmersos en una matriz de PS. Cuando se depositan en una capa fina sobre un sustrato de silicio o de vidrio, y se controla tanto el grosor de la capa como la energía superficial del sustrato, se puede conseguir que los cilindros se posicionen de forma perpendicular y ordenada sobre la superficie.

Para ello, en primer lugar se modificó la energía superficial del sustrato mediante el anclaje de polímeros con una disposición de monómeros aleatoria. Por otro lado, el grosor de la capa fina se controló mediante la concentración de la solución empleada y esta capa

fina se sometió a un tratamiento térmico a 220°C en vacío que permite equilibrar las tensiones superficiales del PS y del PMMA. De este modo, se fabricaron dos plataformas nanoestructuradas con patrones circulares compuestos de cilindros de PMMA (21 y 28 nm de diámetro) separados por una matriz de PS.

Una vez obtenidas las plataformas nanostructuradas, se diseñó un proceso de funcionalización que permitiera la localización de pequeños grupos de ligandos sobre los dominios nanométricos de PMMA. Para ello, se realizó una hidrólisis superficial de los grupos metilos del PMMA, generando así grupos ácidos más reactivos que posibilitan la unión covalente de cualquier molécula con un grupo amino terminal. En este tipo de moléculas se incluyen todas las proteínas y pequeños péptidos, lo cual pone de manifiesto la gran versatilidad de la estrategia de funcionalización.

La caracterización de la disposición espacial de los ligandos se realizó mediante microscopía de fuerzas atómicas, y se corroboró utilizando una novedosa técnica de alta resolución denominada microscopía de reconstrucción óptica estocástica, que permite confirmar el estado de agregación de los ligandos biológicamente activos.

Para validar la utilidad de estas superficies nanoestructuradas, primeramente se inmovilizó un conocido ligando de adhesión celular y se monitorizó la respuesta celular, en concreto evaluando la formación de contactos focales. Los resultados demostraron que sobre estas superficies, los fibroblastos se expandían de tal manera que el área ocupada por las células era equivalente en todos los sustratos. En cambio, cuando se analizó en detalle las estructuras macromoleculares que forman los receptores en la membrana celular tras la activación por parte del ligando, se observaron diferencias significativas. El número de contactos focales formados en la superficie donde los grupos de ligandos estaban más separados, era menor que en aquellos cuya distancia entre ligandos era menor. Por otro lado, aquellas superficies donde los ligandos se presentaban en grupos fomentaban la maduración de los contactos focales, revelando de este modo que este proceso puede manipularse utilizando estrategias de presentación de ligandos como la desarrollada en esta tesis.

Tras verificar el potencial de nuestras plataformas, se indagó en el proceso de agregación del receptor EphB2 ante ligandos (efrinas) con una distribución nanométrica variada. Para alcanzar la resolución espacio-temporal necesaria y ser capaces de distinguir entre los diferentes oligómeros formados por el receptor, se empleó una innovadora técnica que analiza las fluctuaciones en intensidad de cada uno de los pixeles de imágenes de fluorescencia. En combinación con un modelo matemático, se demostró que la agregación de receptores para formar hexámeros y octámeros impulsa la activación máxima del receptor EphB2.

Anteriormente, se había descrito que los ligandos solubles individuales eran incapaces de activar el receptor y de promover su oligomerización. En cambio, la

presentación controlada de ligandos en grupos nanométricos, no sólo fomenta la activación del receptor, sino que además acelera la formación de clústers, demostrando nuevamente la efectividad de los ligandos nanoagrupados como moduladores y potenciadores del dinámico proceso de oligomerización.

A la vista de los resultados obtenidos, se puede concluir que hemos sido capaces de desarrollar una plataforma nanoestrucuturada mediante copolímeros en bloque para su posterior modificación covalente con ligandos celulares cuya distribución en nanoagregados favorece las interacciones multivalentes con los receptores. De este modo, estas plataformas tienen potenciales aplicaciones a la hora de promover una respuesta concreta de los receptores, en función del tamaño del grupo de ligandos y del espaciado entre ellos. Este tipo de ligandos multivalentes se presentan como una atractiva estrategia para activar los complejos receptor-ligando de manera más potente, y por lo tanto, menos costosa. Por lo tanto, las posibles aplicaciones de estos sistemas de presentación de ligandos comprenden desde aplicaciones biotecnológicas a aplicaciones biomédicas, incluyendo sistemas de cultivo celular, materiales bioactivos y administración de fármacos