Síntesis de oligonucleótidos cíclicos y su utilización en el estudio de nuevos motivos estructurales del DNA

Abstract

La presente Tesis Doctoral consta de dos objetivos principales: la optimización de un método de síntesis en fase sólida para la obtención de oligonucleótidos cíclicos y el estudio estructural de diferentes secuencias cíclicas.

En el Capítulo 1 se describe la optimización del método de síntesis así como su aplicación a la obtención de oligonucleótidos cíclicos a gran escala.

En los Capítulos 2,3 y 4 se detalla el estudio estructural mediante difracción de RX, RMN y DC de seis secuencias de octámeros cíclicos: d(pCATTCATT), d(pTGCTCGCT), d(pCGCTCATT), d(pCCGTCCGT), d(pTGCATGCA), d(pAGCTAGCT). Este estudio ha permitido demostrar la existencia de un nuevo motivo estructural del DNA, tipo cuádruplex, formado por dos moléculas de octámero cíclico en disposición antiparalela y estabilizado por la formación de puentes intermoleculares tipo Watson-Crick. Dicho motivo, denominado bi-loop, se ha observado en las seis secuencias estudiadas y tanto en estado sólido como en disolución.

Por último, en el Capítulo 5, se describe el estudio termodinámico realizado a partir de los datos de RMN y curvas de fusión por DC que ha permitido estimar la estabilidad del motivo bi-loop en función de la secuencia oligonucleotídica.