dc.contributor
Universitat de Barcelona. Facultat de Ciències de la Terra
dc.contributor.author
Fernández Valero, Alan Denís
dc.date.accessioned
2024-05-22T09:02:46Z
dc.date.available
2024-05-22T09:02:46Z
dc.date.issued
2024-04-04
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/10803/690925
dc.description
Programa de Doctorat en Ciències del Mar
ca
dc.description.abstract
[eng] Current knowledge of marine fungi is limited, marked by gaps in the understanding of
their diversity, spatio-temporal patterns, and ecological roles within marine ecosystems.
The underexplored nature of specific fungal groups, like chytrids occurring during
phytoplankton blooms, and the lack of research in most marine regions, such as the
Mediterranean Sea, emphasise the need for this thesis.
Consequently, the main objective of this doctoral thesis is to investigate the composition
of the fungal community in the Mediterranean coastal ecosystem, with a focus on the
basal fungal group Chytridiomycota (chytrids). The study sets for specific objectives: i)
to evaluate the spatial distribution of Chytridiomycota diversity in various coastal areas
during dinoflagellate proliferations; ii) to evaluate the temporal dynamics of the fungal
community in epiphytic communities during benthic dinoflagellate proliferations and to
investigate their interaction with hosts; and iii) to identify and describe new parasitic
Chytridiomycota species associated with their host proliferations.
The chytrid community in coastal environments is particularly dynamic and diverse, with
a marked specificity towards their preferred hosts. These communities are more diverse
and abundant in sediments and on macroalgae surfaces than in the water column. The
relative abundance of chytrids increases in the water column during dinoflagellate
proliferations, suggesting their opportunistic parasitic behaviour. In the laboratory, strains
of four chytrid species, including the most abundant species detected by metabarcoding
sequencing, have been cultured and identified by co-culture techniques with
dinoflagellates. Three strains correspond to as yet undescribed species and the cultures
have allowed the morphological and molecular characterisation of two of them,
Dinomyces gilberthii and Paradinomyces evelyniae, which have been newly described
in this thesis. In terms of geographic distribution of species, Dinomyces gilberthii is widely
distributed in coastal Mediterranean habitats particularly during summer dinoflagellate
blooms. Conversely, species like Paradinomyces evelyniae exhibit a more limited
distribution in these habitats. Investigations into the temporal dynamics of the fungal
community on poorly explored niches such as biofilms in macroalgae, revealed an
alternation in the abundance of fungal groups, significantly influenced by the epiphytic
dinoflagellates dynamics. Dominant chytrid species in these communities, such as
Dinomyces arenysensis, exhibit adaptability in their survival strategies, including trophic
versatility.
The findings demonstrate that chytrids play a significant role in the structuring of
planktonic and benthic microbial communities in the coastal ecosystems.
ca
dc.description.abstract
[spa] El conocimiento actual sobre los hongos marinos es limitado, marcado por la falta de
conocimiento de su diversidad, patrones espacio-temporales y funciones ecológicas en
los ecosistemas marinos. El desconocimiento sobre algunos grupos fúngicos
específicos, como los quítridos presentes en proliferaciones fitoplanctónicas, y la falta
de investigación en algunas regiones marinas, como el Mar Mediterráneo, enfatizan la
necesidad de esta tesis.
En consecuencia, el objetivo principal de la tesis doctoral es investigar la composición
de la comunidad fúngica en el ecosistema costero mediterráneo, y concretamente el
grupo de hongos basales Chytridiomycota (quítridos). El estudio establece objetivos
específicos: i) evaluar la distribución espacial de la diversidad de Chytridiomycota en
diversas áreas costeras durante las proliferaciones de dinoflagelados; ii) evaluar la
dinámica temporal de la comunidad fúngica en comunidades epífitas durante
proliferaciones de dinoflagelados bentónicos e investigar su interacción con los
huéspedes; y iii) identificar y describir nuevas especies marinas de Chytridiomycota.
La comunidad de quítridos en ambientes costeros es particularmente dinámica y
diversa, con una marcada especificidad hacia sus huéspedes preferentes. Estas
comunidades son más diversas y abundantes en los sedimentos y en superficies que
en la columna de agua. La abundancia relativa de los quítridos aumenta en la columna
de agua durante la proliferación de dinoflagelados, sugiriendo su comportamiento
parasítico oportunista en situaciones de alta abundancia del huésped. En el laboratorio,
se han cultivado e identificado cepas de cuatro especies de quitridos, incluyendo las
especies más abundantes detectadas por secuenciación de metabarcodificación,
mediante técnicas de co-cultivo con dinoflagelados. Tres cepas corresponden a
especies aún no descritas y los cultivos han permitido la caracterización morfológica y
molecular de dos de ellas, Dinomyces gilberthii y Paradinomyces evelyniae, las cuales
han sido formalmente descritas en esta tesis. En términos de distribución geográfica de
las especies, Dinomyces gilberthii, está ampliamente distribuido en hábitats costeros
mediterráneos, particularmente prevalente durante las proliferaciones estivales de
dinoflagelados. En cambio, especies como Paradinomyces evelyniae muestran una
distribución más limitada en estos hábitats. La investigación sobre la dinámica temporal
de la comunidad fúngica en nichos poco estudiados, como los biofilms en macroalgas,
ha permitido observar una alternancia en la abundancia de los grupos fúngicos,
influenciada significativamente influenciada por la dinámica de dinoflagelados epífitos.
Especies dominantes de quítridos en estas comunidades, como Dinomyces
arenysensis, exhiben adaptabilidad en sus estrategias de supervivencia, incluida
versatilidad trófica.
Los resultados obtenidos demuestran que los quítridos desempeñan un papel
significativo en la estructuración de las comunidades microbianas planctónicas y
bentónicas de los ecosistemas costeros.
ca
dc.format.extent
202 p.
ca
dc.publisher
Universitat de Barcelona
dc.rights.license
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ca
dc.rights.uri
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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dc.source
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject
Ecologia aquàtica
ca
dc.subject
Ecología acuática
ca
dc.subject
Aquatic ecology
ca
dc.subject
Parasitisme
ca
dc.subject
Parasitismo
ca
dc.subject
Dinoflagel·lades
ca
dc.subject
Dinoflagelados
ca
dc.subject
Dinoflagellates
ca
dc.subject.other
Ciències Experimentals i Matemàtiques
ca
dc.title
Delivering insights into diversity and ecology of marine chytrids
ca
dc.type
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.contributor.director
Garcés, Esther, 1970-
dc.contributor.director
Reñé Vicente, Albert
dc.contributor.tutor
Vidal Barcelona, Montserrat
dc.rights.accessLevel
info:eu-repo/semantics/openAccess