Biomineralization Induction for 3D Bioprinted Osteogenic Structures Informed by Bioimaging-Biomodelling Techniques Through Geometrical Efficiency, and Hydrogel Optimization

Author

Abdallah, Yomna Khalid Ibrahim Mohammed

Director

Estevez, Alberto T. ORCID

Mozafari, Masoud

Date of defense

2024-07-25

Pages

217 p.



Department/Institute

Universitat Internacional de Catalunya. Departament d'Arquitectura

Doctorate programs

Doctorate in Health Science Program (Bioengineering)

Abstract

The Current work presents an interdisciplinary study with the objective to design and fabricate acellular chemically mineralized biomimetic osteo-structures of multi applications. Inspired by the Cancellous-Cortical hierarchical level in bone tissue and by the bone biomineralization process. By combining organic and mineral components to achieve mineralized material for bone replacement material application or as a mineralized architectural material. This was tackled through a customized methodology to address the different disciplines included in the current study. First, analysing bone tissue on the cancellous-cortical level in terms of morphometric parameters correlation with the universal mechanical properties of bone, as an informative model for biomimetic design of bone-like optimized structures and bioengineered materials. Discussed in Chapter 1. Second, a biomimetic approach to synthesize an optimized and sustainable acellular chemically mineralizing hydrogel from Calcium phosphate dibasic enhanced sodium alginate-gelatine hydrogel without and with integrating living cells to achieve enhanced hydrogel stability, antimicrobial resistance, mineralization and enhanced mechanical properties for both proposed applications. Discussed in Chapter 2. Third, by employing Deep Learning generative design tools (CNN, Diffusion Models, and transformers based on NL Processing) to generate 2D sequence Images for data augmentation and design generation as well as 3D voxel and mesh models for direct integration in the biomimetic design to fabrication process informed by the first two chapters to design and fabricate bone-like structures on the cancellous-cortical bone level. Discussed in Chapter 3, and Chapter 4. The results revealed a strong correlation between the Young ́s modulus and the Trabecular bone volume and Trabecular Structure thickness. In addition to dependency of the maximum strain on the Cortical parameters as Cortical Bone Volume, and Cortical structure density. The 6% CPDB enhanced SA-Gelatine based hydrogel achieved the best rheological properties in terms of equilibrium between elasticity and rigidity. The SEM images of the hydrogel and bioink; proved the significant potency of the hydrogel to mineralize through forming hydroxyapatite platelets when incubated in the open air in non-sterile conditions, as well as when incubated in FBS for a duration of up to 14 days, with a congruent increase in mineralization over time. Finally, the results revealed that 2D μ-CT images are less efficient when employed as input for a 2D-CNN convolution generative process in data augmentation or in biomimetic design generation, in comparison to the AI-Diffusion generated 2D images. Furthermore, the results revealed possible integration of text-to-3D model in direct rapid prototyping as well as a volumetric unlimited rapid and open access AI generative biomimetic design to fabrication tool. However, it is proved the need for increasing the training data set of 3D reconstructs representing the various scale lengths and fine resolution details of the bone tissue, as well as in increasing the capacity of the text-to-3D model in learning from 2D text-to-image diffusion models in understanding intricate scales and morphologies of bone tissue. The results revealed the significance and novelty of the study in relating these three aspects combining advanced bone imaging and mechanical testing in informing biomimetic material and structural design. While emphasizing on the potential of AI-DL generative design tools in accelerating, facilitating and augmenting the feasibility of biomimetic design to fabrication of bone inspired hybrid-hierarchical structures that can serve as bone replacement materials and grafts or as architectural materials and structures.


El treball actual presenta un estudi interdisciplinari amb l'objectiu de dissenyar i fabricar acel·lulars Osteoestructures biomimètiques mineralitzades químicament de múltiples aplicacions. Inspirat en el nivell jeràrquic esponjoso-cortical en el teixit ossi i pel procés de biomineralització òssia. En combinar components orgànics i minerals per aconseguir material mineralitzat per a la substitució òssia aplicació material o com a material arquitectònic mineralitzat. Això es va abordar a través d'un personalitzat metodologia per abordar les diferents disciplines incloses en el present estudi. Primer, analitzant el teixit ossi a nivell esponjoso-cortical pel que fa als paràmetres morfomètrics de correlació amb l'universal Propietats mecàniques de l'os, com a model informatiu per al disseny biomimètic d'os optimitzat estructures i materials de bioenginyeria. Es comenta al capítol 1. En segon lloc, un enfocament biomimètic sintetitzar un hidrogel químicament mineralitzant acel·lular optimitzat i sostenible a partir de fosfat de calci Hidrogel dibàsic d'alginat de sodi-gelatina millorat sense i amb cèl·lules vives integrades per aconseguir una millora estabilitat d'hidrogel, resistència antimicrobiana, mineralització i propietats mecàniques millorades per ambdues sol·licituds proposades. Es comenta al capítol 2. En tercer lloc, emprant el disseny generatiu de Deep Learning eines (CNN, models de difusió i transformadors basats en processament NL) per generar imatges de seqüència 2D per a l'augment de dades i la generació de dissenys, així com models de voxel i malla 3D per a la integració directa en el procés de disseny biomimètic a fabricació informat pels dos primers capítols per dissenyar i fabricar estructures semblants a l'os a nivell de l'os esponjoso-cortical. Es comenta al capítol 3 i al capítol 4. Els resultats va revelar una forta correlació entre el mòdul de Young i el volum ossi Trabecular i Trabecular Gruix de l'estructura. A més de la dependència de la tensió màxima dels paràmetres corticals com Volum de l'os cortical i densitat de l'estructura cortical. L'hidrogel basat en SA-Gelatina millorat al 6% de CPDB va aconseguir les millors propietats reològiques en termes d'equilibri entre elasticitat i rigidesa. Les imatges SEM de l'hidrogel i la biotinta; va demostrar la significativa potència de l'hidrogel per mineralitzar mitjançant la formació de plaquetes d'hidroxiapatita quan s'incuben a l'aire lliure en condicions no estèrils, així com quan s'incuba en FBS durant una durada de fins a 14 dies, amb un augment congruent de la mineralització al llarg del temps. Finalment, els resultats van revelar que les imatges 2D μ-CT són menys eficients quan s'utilitzen com a entrada per a un Procés generatiu de convolució 2D-CNN en l'augment de dades o en la generació de dissenys biomimètics, en comparació amb les imatges 2D generades per AI-Diffusion. A més, els resultats van revelar possibles integració del model text a 3D en el prototipat ràpid directe, així com un volum il·limitat ràpid i obert accedir al disseny biomimètic generatiu d'IA a l'eina de fabricació. No obstant això, està demostrada la necessitat d'augmentar la conjunt de dades d'entrenament de reconstruccions en 3D que representen les diferents longituds d'escala i detalls de resolució fina del teixit ossi, així com en augmentar la capacitat del model de text a 3D per aprendre de text a imatge 2D: models de difusió per entendre escales i morfologies intricades del teixit ossi. Els resultats van revelar el importància i novetat de l'estudi en relacionar aquests tres aspectes combinant imatges òssies avançades i assaigs mecànics per informar el material biomimètic i el disseny estructural. Tot posant èmfasi en el potencial de les eines de disseny generatiu AI-DL per accelerar, facilitar i augmentar la viabilitat de disseny biomimètic per a la fabricació d'estructures jeràrquiques híbrides inspirades en l'os que poden servir d'os materials de substitució i empelts o com a materials i estructures arquitectòniques.

Keywords

Biomineralization; Hydrogel; Micro Computed Tomography; Rheological Properties; Bone- Imagine; Convolution Neural Networks; 3D Diffusion Models; Biomimetic Scaffold Design

Subjects

72 - Architecture

Knowledge Area

Bioingeniería

Documents

Tesis Yomna K. Abdallah.pdf

6.537Mb

Rights

L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/

This item appears in the following Collection(s)