Susceptibilidad antifúngica y filogenia molecular de especies del género fusarium de interés clínico

Abstract

RESUMEN: “Susceptibilidad antifúngica y filogenia molecular de especies del género Fusarium de interés clínico” Fusarium solani, Fusarium oxysporum y Fusarium verticillioides, así como otras especies del género menos frecuentes, son importantes patógenos oportunistas para el hombre, para las cuales aún no existe un tratamiento eficaz. Además, la sensibilidad al tratamiento antifúngico varía en función de la especie, por lo que la identificación a nivel de especie de los aislados clínicos es de gran interés. Sin embargo, esta identificación resulta compleja en base a sus caracteristicas morfológicas. Las nuevas técnicas de biología molecular han permitido facilitar su identificación así como establecer criterios más adecuados para delimitar las diferentes especies del género. Por todo ello, en la presente tesis se ha pretendido: seleccionar los marcadores genéticos más adecuados para la identificación molecular de las especies del género; determinar la existencia de grupos filogenéticos diferenciados entre los aislados de cada una de las especies identificadas y evaluar la actividad in vitro de diferentes antifúngicos, frente a las especies de Fusarium de interés clínico y, averiguar si existen diferencias en cuanto a la sensibilidad antifúngica de los grupos filogenéticos obtenidos. El análisis multigénico realizado con aislados de F. solani ha confirmado que constituye un complejo de especies, que presenta una elevada resistencia frente a todos los antifúngicos ensayados. El análisis del gen del EF-1α ha confirmado la identificación de cuatro grupos filogenéticos dentro del complejo de F. oxysporum que han mostrado diferente sensibilidad antifúngica in vitro frente a la terbinafina. La región TUB del gen de la β-tubulina ha resultado ser un excelente marcador molecular para identificar el resto de especies de interés clínico que, en su mayoría, han mostrado sensibilidad frente a la terbinafina.

Summary: “Antifungal susceptibility and molecular phylogeny of the genus fusarium of clinical interest” Introduction. Fusarium solani, Fusarium oxysporum and Fusarium verticillioides, as well as other less frequent species of the genus, are important opportunists pathogenic to Man for which there is still no effective treatment. In addition, sensitivity to effective antifungal treatments varies depending on species, therefore identification of samples to species level is of primary interest. However, identification on the basis of morphological characteristics can be difficult. New techniques in molecular biology have made identification easier and allowed more adequate criteria to be established in order to delimit the species of the genus. Aims. To select better genetic markers for the molecular identification of the species of the genus, to determine the existence of phylogenetic groups that can delimit samples of each of the species identified, to evaluate the in vitro activity of different antifungals against species of Fusarium of clinical interest, and to find out if there are any differences with respect to the antifungal sensitivity of the phylogenetic groups obtained. Findings. Multigenetic analysis carried out with samples of F.solani have confirmed that it is a species complex that presents a high resistance against all the antifungals tested. The analysis of gene EF-1α has confirmed the identification of four phylogenetic groups within the F.oxysporum complex that have shown different antifungal sensitivity in vitro against terbinafine. The TUB region of the gene of β-tubulina has proven to be an excellent molecular marker for identifying the other species of clinical interest that have shown sensitivity primarily against terbinafine.