Local adaptation of wild populations of Arabidopsis thaliana to coastal and inland habitats in Catalonia

dc.contributor
Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Animal, de Biologia Vegetal i d'Ecologia
dc.contributor.author
Busoms González, Sílvia
dc.date.accessioned
2017-03-04T17:14:04Z
dc.date.available
2017-03-04T17:14:04Z
dc.date.issued
2015-11-20
dc.identifier.isbn
9788449062339
en_US
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/10803/401010
dc.description.abstract
La variació genètica natural existent entre poblacions d' Arabidopsis thaliana a Catalunya s'ha utilitzat per identificar fenòmens d'adaptació local a hàbitats costaners i continentals. Es va crear un Model de Distribució d'Espècies (SMD) per localitzar petits rodals de poblacions biològiques d' A. thaliana ('demes'). Els resultats obtinguts de la utilització de 425 marcadors (SNP) sotmesos a anàlisis d'estructura de la població i d'agrupament indiquen un alt percentatge d'al∙lels compartits entre 'demes'. Durant dos anys consecutius es va repetir un experiment de trasplantament recíproc en condicions naturals dissenyat per mesurar l'aptitud de les plantes procedents de 'demes' continentals i costaneres als dos tipus d'hàbitats. La progènie d'aquestes 'demes' va mostrar una millor aptitud quan creixia en els seu hàbitat d'origen. En experiments realitzats amb sòl procedent de la costa i de l'interior sota condicions controlades en cambra de cultiu es van obtenir uns resultats similars, confirmant‐se que el tipus de sòl és un factor determinant per l'adaptació local. A més, les plantes procedents de 'demes' costaneres van mostrar una millor aptitud i tolerància sota condicions d'elevada salinitat. Es conclou que A. thaliana està adaptada als ambients costaners i aquesta adaptació és impulsada en gran part per l'elevada salinitat dels sòls costaners. Tots els resultats apunten que les plantes costaneres utilitzen més d'un mecanisme per combatre els alts nivells de Na al sòl. És probable que AtSOS1 i AtHKT1;1 treballin conjuntament per traslladar el Na a les fulles i emmagatzemar‐lo dins les vacuoles per aconseguir un millor ajust osmòtic. D'altra banda, creuaments entre plantes costaneres (tolerants a la sal) i plantes de l'interior (sensibles a la sal) apunten a una possible herència materna del caràcter "tolerància a la salinitat". Els polimorfismes detectats tant en AtHKT1;1 com en AtMOT1 poden tenir un significat adaptatiu ja que els al∙lels febles d'ambdós només es van detectar en 'demes' costaneres. No obstant, tots els resultats indiquen que la variabilitat genètica d' AtHKT1;1 no és responsable de la tolerància a la salinitat observada. Hem arribat a la conclusió que l'al∙lel feble d' AtHKT1;1 persisteix i conviu amb plantes que tenen l'al∙lel fort gràcies a una floració primerenca i a una millor tolerància a la salinitat moderada. D'altra banda, l'al∙lel feble d' AtMOT1 és més freqüent i es va detectar en zones més properes al mar que l'al∙lel feble d' AtHKT1;1. Els resultats d'estudis de salinitat amb mutants noquejats d' AtMOT1 indiquen que la pèrdua de funció d' AtMOT1 podria augmentar la tolerància a l'estrès salí.
en_US
dc.description.abstract
The natural genetic variation among A. thaliana populations in Catalonia was used to identify local adaptation to coastal and inland habitats. A Species Distribution Model (SMD) was created to locate multiple small stands of A. thaliana (demes). Results using 425 genome‐wide SNP markers under clustering and population analysis indicate a high percentage of shared alleles among demes. Multi‐year field‐based reciprocal transplant experiments were designed to identify fitness trade‐offs between inland and coastal demes. Progenies from these demes performed better in their local/home environments. Similar results were obtained in greenhouse common garden experiments, confirming that soil is a driving factor for local adaptation. Plants from the coastal habitat outperformed those from inland when grown together under high salinity. It is concluded that A. thaliana is locally adapted to coastal environments, and this adaptation is driven, at least in part, by the elevated salinity of coastal soils. Our results do not point to a single mechanism of salinity tolerance. AtSOS1 and AtHKT1;1 may cooperate increasing leaf Na+ and its vacuolar storage achieving better osmotic adjustment. Crossings between coastal (salt tolerant) and inland (salt sensitive) plants suggest maternally inheritance of salt tolerance. Polymorphisms in both AtHKT1;1 and AtMOT1 may be of adaptive significance because the weak alleles were only detected in coastal demes. However, all results indicate that genetic variability in AtHKT1;1 allele is not responsible for the salinity tolerance. We conclude that the weak allele of AtHKT1;1 persists and coexists with plants bearing the strong allele thanks to early flowering and better tolerance of moderate salinity. Moreover, the weak allele of AtMOT1 was more frequent and was detected nearer to the sea than the weak allele of AtHKT1;1. Results with mot1 knockout mutants under NaCl treatments indicate that loss of function of AtMOT1 may enhance tolerance to salt stress
en_US
dc.format.extent
195 p.
en_US
dc.format.mimetype
application/pdf
dc.language.iso
eng
en_US
dc.publisher
Universitat Autònoma de Barcelona
dc.rights.license
L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.rights.uri
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
*
dc.source
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject
Adaptació local
en_US
dc.subject
Adaptación local
en_US
dc.subject
Local adaptation
en_US
dc.subject
Salinitat
en_US
dc.subject
Salinidad
en_US
dc.subject
Salinity
en_US
dc.subject
Arabidopsis
en_US
dc.subject.other
Ciències Experimentals
en_US
dc.title
Local adaptation of wild populations of Arabidopsis thaliana to coastal and inland habitats in Catalonia
en_US
dc.type
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.subject.udc
573
en_US
dc.contributor.authoremail
sbusoms@gmail.com
en_US
dc.contributor.director
Poschenrieder, Charlotte
dc.contributor.director
Edward Salt, David
dc.embargo.terms
cap
en_US
dc.rights.accessLevel
info:eu-repo/semantics/openAccess


Documents

sbg1de1.pdf

5.041Mb PDF

Aquest element apareix en la col·lecció o col·leccions següent(s)