Calicivirus infection among hospitalized children

Abstract

Els calicivirus humans (HuCV) són una causa important de brots de gastroenteritis (GEA) en adults, el paper però d'aquests virus com a causa de casos esporàdics de GEA en nens és desconegut<br/>Objectius<br/>1. Estudiar la prevalença i les característiques clíniques del les infeccions per HuCV en nens hospitalitzats als USA<br/>2. Determinar la diversitat genètica dels HuCV causants d'aquesta patologia<br/>3. Determinar el cost mèdic derivat d'aquestes infeccions<br/>Metodes<br/>Es va realitzar un estudi prospectiu a tres hospitals pediàtrics dels USA, a Cincinnati, OH; Oakland, CA; i Norfolk, VA. Nens de 14 dies fins a 5 anys d'edat ingressats per un quadre de diarrea, vòmits o febre sense causa de menys de 7 dies d'evolució van ser inclosos. Es van recollir dades clíniques i demogràfiques, així com una mostra de femta. La femta es va analitzar per la presencia de rotavirus (RV) per EIA i per HuCV per RT-PCR utilitzant els cebadors 289/290 i 289hi/290hijk, dirigits a la regió de la polimerasa i que són capaços de detectar NLV i SLV. Totes les mostres positives per RT-PCR van ser confirmades per sequenciació utilitzant SequiTherm EXCEL II long-Read DNA Sequencing kit-ALF en un seqüenciador automàtic. Els arbres filogenètics es van obternir utilitzant l'algoritme de Maximum likelihood. Es va calcular el cost del periode pre, hospitalització i posthospitalització a partir del nombre de visites a serveis mèdics, les medicacions prescrites, les exploracions complementàries solicitades i el cost de la hospitalització. <br/>Resultats<br/>Es van obtenir 1844 mostres. Es van detectar RV en 27% de les mostres i HuCV en un 8%. Dels 155 HuCV, 25 eren SLVs i 130 NLVs. L'edat dels pacients infectats per RV era superior a la dels infectats per HuCV (mitjana 13 mesos vs 8 mesos). Els RV van mostrar un predomini estacional durant l'hivern, mentre que els HuCV van ser més freqüents a finals d'hivern-principis de primavera. Es va detectar co-infecció amb RV en 12% dels pacients infectats per HuCV. El símptoma més freqüent en les infeccions per HuCV van ser els vòmits (79% dels pacients). La febre va ser el signe més freqüent en nens de menys de 3 mesos d'edat. La gravetat dels quadres produits per SLV i NLV van ser similars. <br/>La mitjana de cost per pacient va ser de $3,574 (interval $820-$116,088).<br/>L'analisi filogenètic de les soques aïllades mostrà 3 soques pertanyent als SLV amb menys d'un 70% d'identitat amb les soques de referència i 7 NLV que no pertanyien a cap dels dos genotips, mostrant menys d'un 65% identitat a nivell nucleòtid amb les soques de referència<br/>Conclusions <br/>Els HuCVs són una causa important de GEA en nens als USA, afectant pacients de menor edat que els RV i mostrant un patró estacional diferent.<br/>Els HuCV causant de GEA són geneticament diversos. No es van poder demostrar diferències en la presentació clínica ni en les característiques epidemiològiques de les infeccions pels diferents géneres.<br/>El cost economic i social d'aquestes infeccions és important

Human calicivirus (HuCV) are an important cause of gastroenteritis (AGE) outbreaks in adults but the role of this virus as a cause of sporadic gastroenteritis in children is not known.<br/>Objectives<br/>1. To asses the prevalence and clinical characteristics of HuCV infection among children resulting in hospitalization in the USA.<br/>2. To determine the genetic diversity of the HuCV causing this severe illness<br/>3. To determine the direct medical cost and burden cause by these infections <br/>Methods<br/>Patients were enrolled in a longitudinal prospective maneer at three pediatric hospitals in Cincinnati, OH; Oakland, CA; and Norfolk, VA. Children 14 days to 5 years of age admitted because of diarrhea, vomiting or fever of less than 7 days duration at admission were enrolled. Clinical and demografic information were collected, as well a stool sample. Stools were tested for rotavirus (RV) by EIA and stored at -70ºC until being tested for HuCV. Samples were tested for HuCV by RT-PCR using primers 289/290 and 289hi/290hijk targeting the polimerase region and able to detect NLV and SLV. All the positives by RT-PCR were confirmed by sequencing using SequiTherm EXCEL II long-Read DNA Sequencing kit-ALF on an automated sequencer. Phylogenetic trees were obtained using Maximum likelihood algoritm. The cost of pre, hospitalization and posthospitalization period was calculated based on the cost of visits to a health care provider, tests ordered, medications prescribed and cost of hospitalization. <br/>Results<br/>1844 samples were available for testing. The detection rates for RV and HuCV were 27% and 8% respectively. Of 155 samples positive for HuCV, 25 were SLVs and 130 NLVs. Patients infected by RV were older than those infected by HuCV (median 13 months vs 8 months). RV had winter seasonality while HuCV was more frequent during late winter/early spring. Co-infection with RV occurred in 12% of the HuCV -positive patients. The most common symptom in HuCV infected patients was vomiting (79%). SLV was associated with more vomiting (86%) compared to NLV (79%). Fever was a frequent symptom, specially in children less than 3 months of age. Severity for SLV and NLV were similar. <br/>The median cost for calicivirus infected patients was $3,574 (range $820-$116,088).<br/>Phylogenetic analysis of the isolated strains showed 3 SLV samples that were less than 75% identical to the reference strains. Seven of the NLV strains did not fall in any ot the two genotypes showing less than 65% identity at nucleotide level to any of the reference strains.<br/>Conclusions <br/>HuCVs are a relevant cause of severe AGE in children in USA. Seasonality and epidemiology for RV was different than for HuCV.<br/>HuCV causing AGE in children are genetically diverse. No differences regarding clinical presentation and demographic characteristics could be proved for the different genera or clusters.<br/>HuCV infection has an important economical and social cost.