Development of a personalized multifactorial model for intestinal microbial health evaluation

Author

Pujolassos Tanyà, Meritxell

Director

Calle, M. Luz

Date of defense

2024-09-12

Pages

182 p.



Department/Institute

Universitat de Vic - Universitat Central de Catalunya. Departament de Biociències

Doctorate programs

Ciències Experimentals i Tecnologies

Abstract

Aquesta tesi s’ha desenvolupat sobre dues línies d’investigació claus en l’estudi del microbioma, que són completament complementàries: la metodologia per l’anàlisi de les dades composicionals de microbioma i la seva aplicació pràctica per la identificació de signatures bacterianes associades a salut. Per una banda, la tesi aborda la problemàtica de la composicionalitat de les dades del microbioma proposant una nova metodologia, en el context de l’anàlisi de dades composicionals, enfocada en la predicció. L’aplicació d’aquest nou mètode utilitzant dades públiques és el que permet posteriorment estudiar la relació entre el microbioma intestinal i la salut humana, proposant un model multidimensional per avaluar l’estat de salut general de la població basat en la composició del microbioma. Aquest model pretén proporcionar una visió global de l’estat de salut intestinal mitjançant la identificació de desequilibris associats a un baix estat de salut.[CA]


This thesis has been motivated by two research lines in the study of the microbiome that are completely complementary: the methodology for analysing compositional microbiome data and its practical application for identifying bacterial signatures associated with health. On one hand, the thesis addresses the challenge of microbiome data compositionality by proposing a new approach within the context of compositional data analysis focused on prediction. The application of this novel method using public available data, allows for the study of gut microbiome and human health, and proposes a multidimensional model to assess the general health status of the population based on microbiome composition. This model aims to provide a comprehensive view of intestinal health by identifying imbalances associated with a lower health status.[EN]

Keywords

Metagenomics; Bacterial composition; Survival data; Metagenòmica; Composició bacteriana; Dades de supervivència

Subjects

575 - General genetics. General cytogenetics. Immunogenetics. Evolution. Phylogeny

Knowledge Area

Genòmica

Documents

tesdoc_a2024_pujolassos_mertitxell_development_personalized.pdf

26.77Mb

 

Rights

L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

This item appears in the following Collection(s)