Universitat de Lleida
Alves, Rui
Solsona Tehàs, Francesc
2025-02-17
119 p.
La modelització matemàtica és una habilitat necessària per a la biologia de sistemes i la biologia sintètica. No obstant això, dominar la creació de models matemàtics per a la biologia molecular de sistemes sol implicar una corba d'aprenentatge pronunciada. Malgrat la disponibilitat de nombroses eines de modelització, poques incorporen una interfície d’usuari que agilitzi aquest procés. EasyModel ha estat dissenyat amb una filosofia de fàcil ús per reduir la corba d'aprenentatge de l’usuari, oferint una interfície gràfica intuïtiva amb elements de guia. Tècnicament, es tracta d’una aplicació web “full-stack” que utilitza el motor de Mathematica per realitzar els càlculs numèrics. L’aplicació permet el modelatge, la simulació i l’anàlisi dins els règims determinista i estocàstic. Els usuaris experts poden descarregar el fitxer “notebook” de Mathematica generat per personalitzar l’anàlisi. L'eina es troba disponible a: https://easymodel.udl.cat.
La modelización matemática es una habilidad necesaria para la biología de sistemas y la biología sintética. Sin embargo, dominar la creación de modelos matemáticos para la biología molecular de sistemas suele implicar una curva de aprendizaje pronunciada. A pesar de la disponibilidad de numerosas herramientas de modelización, pocas incorporan una interfaz de usuario que agilice este proceso. EasyModel ha sido diseñado con una filosofía de fácil uso para reducir la curva de aprendizaje del usuario, ofreciendo una interfaz gráfica intuitiva con elementos de guía. Técnicamente, se trata de una aplicación web “full-stack” que utiliza el motor de Mathematica para realizar los cálculos numéricos. La aplicación permite el modelado, la simulación y el análisis en los regímenes determinista y estocástico. Los usuarios expertos pueden descargar el archivo “notebook” de Mathematica generado para personalizar el análisis. La herramienta está disponible en: https://easymodel.udl.cat.
Mathematical modeling is a necessary skill for systems and synthetic biology. However, mastering the creation of mathematical models for molecular systems biology often involves a steep learning curve. Despite the availability of numerous modeling tools, few incorporate a user interface that streamlines this process. EasyModel has been designed with a user-friendly philosophy to reduce the user's learning curve, offering an intuitive graphical interface with guided elements. Technically, it is a full-stack web application that uses the Mathematica engine to perform numerical calculations. The application enables modeling, simulation, and analysis in both deterministic and stochastic regimes. Expert users can download the generated Mathematica notebook file to customize the analysis. The tool is available at: https://easymodel.udl.cat.
Sistema biològic; Fàcil; Mathematica; Sistema biológico; Fácil; Systems biology; User-friendly
004 - Computer science
Ciències de la Computació i Intel·ligència Artificial
ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
