Functional Genetics of Suberin: The Role of CYP86A33 and StKCS6 in potato tuber periderm

Abstract

La caracterització funcional de dos gens en la peridermis, la &#969; hidroxilasa d'àcids grassos CYP86A33 -candidata per la funcionalització del carboni &#969;-terminal dels monòmers alifàtics de la suberina- i la ketoacyl-CoA sintasa StKCS6 -candidata per elongar àcids grassos o derivats llargs de suberina i ceres- es realitza per silenciament per RNA d'interferència en patata. <br/>La deficiència de CYP86A33 comporta una gran reducció dels monòmers principals de la suberina, l'àcid gras &#969;-hidroxilat i l'&#945;,&#969;-diàcid C18:1, juntament amb una reducció total de la quantitat de suberina del 60%. Aquesta deficiència altera l'estructura lamel·lar típica de la suberina, així com també la funció barrera de la peridermis. <br/>La deficiència en StKCS6 comporta que els monòmers de la suberina de 28 carbonis o més llargs es redueixin i que els de 26 carbonis o més curts s'incrementin. Aquesta deficiència suggereix que la llargada dels compostos alifàtics pot contribuir a les propietats impermeabilitzants de la peridermis.

The functional characterization of two genes in the periderm, the &#969;-hydroxylase CYP86A33 -candidate for the functionalization of the &#969;-terminal carbon of suberin aliphatic compounds- and the putative ketoacyl-CoA synthase StKCS6 -candidate for the elongation of VLCFA and derivatives of suberin and waxes of periderm- is performed by RNA interference-mediated silencing in potato <br/>The CYP86A33 deficiency leads to a great reduction of the main suberin monomers, the C18:1 &#969;-hydroxyacid and &#945;,&#969;-diacid, together with an overall decrease of the suberin total amount by 60%. The deficiency in these &#969;-oxidized fatty acids alters the typical suberin lamellar structure as well as the periderm water barrier function.<br/>StKCS6 deficiency leads to a decrease of suberin and wax compounds with chain-length C28 and higher and an increase of those with chain-length C26 and lower. This deficiency suggests that the aliphatics chain-length can contribute to the sealing properties of periderm.