The Consequences of stochastic gene expression in the nematode Caenorhabditis elegans

dc.contributor
Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.contributor.author
Burga Ramos, Alejandro Raúl
dc.date.accessioned
2013-02-14T10:59:08Z
dc.date.available
2013-02-14T10:59:08Z
dc.date.issued
2012-07-20
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/10803/104484
dc.description.abstract
Genetically identical cells and organisms growing in homogenous environmental conditions can show significant phenotypic variation. Furthermore, mutations often have consequences that vary among individuals (incomplete penetrance). Biochemical processes such as those involved in gene expression are subjected to fluctuations due to their inherent probabilistic nature. However, it is not clear how these fluctuations affect multicellular organisms carrying mutations and if stochastic variation in gene expression among individuals could confer any advantage to populations. We have investigated the consequences of stochastic gene expression using the nematode Caenorhabditis elegans as a model. Here we show that inter-individual stochastic variation in the induction of both specific and more general buffering systems combine to determine the outcome of inherited mutations in each individual. Also, we demonstrate that genetic and environmental robustness are coupled in C. elegans. Individuals with higher induction of stress response are more robust to the effect of mutations, however they incur a fitness cost, thus suggesting that variation at the population level could be beneficial in unpredictable environments.
eng
dc.description.abstract
Células y organismos genéticamente idénticos y creciendo en un ambiente homogéneo pueden mostrar diferencias en sus fenotipos. Además, una misma mutación puede afectar de un modo distinto a individuos de una misma población. Es sabido que los procesos bioquímicos responsables de la expresión de genes están sujetos a fluctuaciones debido a su inherentemente naturaleza probabilística. Sin embargo, el rol que juegan estas fluctuaciones en individuos portadores de mutaciones ha sido poco estudiado, así cómo si la expresión estocástica de genes puede conferir alguna ventaja al nivel poblacional. Para investigar las consecuencias de la expresión estocástica de genes usamos como modelo al nemátodo Caenorhabditis elegans. En este trabajo demostramos que existe variación entre individuos en la inducción de mecanismos (tanto gen-específicos como globales) que confieren robustez al desarrollo. En consecuencia, diferencias fenotípicas entre mutantes están determinadas por su variación. También, demostramos que la robustez a perturbaciones genéticos y ambientales están estrechamente ligadas en C. elegans. Individuos que inducen estocásticamente una mayor respuesta a stress, están fenotípicamente mejor protegidos al efecto de mutaciones pero incurren en un costo reproductivo importante. Eso sugiere, que variaciones estocásticas al nivel poblacional pueden ser benéficas cuando las poblaciones afrontan ambientes impredecibles.
spa
dc.format.extent
216 p.
dc.format.mimetype
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Universitat Pompeu Fabra
dc.rights.license
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dc.source
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject
Caenorhabditis elegans
dc.subject
Stochastic gene expression
dc.subject
Genetics
dc.subject
Incomplete penetrance
dc.subject
Redundancy
dc.subject
Robustness
dc.subject
Evolution
dc.title
The Consequences of stochastic gene expression in the nematode Caenorhabditis elegans
dc.type
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.subject.udc
575
cat
dc.contributor.authoremail
alejandro.burga@crg.es
dc.contributor.director
Lehner, Ben
dc.embargo.terms
cap
dc.rights.accessLevel
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.identifier.dl
B. 5699-2013
dc.description.degree
Programa de doctorat en Biomedicina


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