Estudi de les (beta)-lactamases plasmídiques d'espectre ampliat, cefamicinases i carbapenemases en diferents ecosistemes. Anàlisi del seu entorn genètic

Abstract

La Tesi descriu la prevalença de les soques portadores de betalactamases d'espectre ampliat (BLEA), cefamicinases i carbapenemases, principals mecanismes de resistència als antibiòtics betalactàmics, no només en l'àmbit clínic [mostres clíniques i malalts atesos al Servei d'Urgències (portadors fecals)] sinó en altres ecosistemes com en els subsòls de granges d'animals (aus, porcs i conills), en aigües residuals humanes, en aliments, i en portadors fecals afectats per un brot alimentari. A més a més s'han caracteritzat aquests enzims per tal de determinar la freqüència de cadascun dels tipus de betalactamases presents: tipus TEM, SHV i CTX-M com a BLEA, CMY, DHA o ACC com a cefamicinases, o VIM, IMP i altres com a carbapenemases. La conclusió del treball mostra com aquests enzims es poden trobar en tots els ecosistemes avaluats i, per tant, com la selecció de soques portadores d'aquests no es dóna només en l'àmbit clínic sinó que roman en tot l'entorn humà. Per altra banda, arran d'aquest treball s'han descrit dues noves betalactamases, la CTX-M-14b, i la CTX-M-51, ambdues derivades de la CTX-M-9. <br/>El fet que les soques portadores d'aquests enzims s'hagin trobat en tots els àmbits és causa de greu preocupació. Cal, doncs, intentar evitar la selecció d'aquestes soques, així com esbrinar quin o quins són els mecanismes que han permès aquesta expansió. L'estudi epidemiològic dels mecanismes de resistència, és de gran interès, no només en l'àmbit clínic sinó també veterinari, perquè coneixent la prevalença i el tipus d'enzims implicats es pot actuar oportunament dissenyant polítiques d'antibiòtics correctes.

This thesis describes the prevalence of strains carrying extended spectrum betalactamase (ESBL), plasmid-mediated AmpC and carbapenemase. There are the main mechanism of betalactam resistance, not only in clinic environment [clinical samples and patients attending the emergency room (faecal carriers)] also in others environments such as the floor of animal farms (poultry, pig and rabbit), the urban sewage, food, and human faecal carriers in the context of food-borne disease outbreaks. We have characterized these enzymes to know the frequency of each type of betalactamase: TEM, SHV and CTX-M type as ESBL, CMY, DHA and ACC as plasmid-mediated AmpC, or VIM, IMP and others as carbapenemase. The work's conclusion show's that these enzymes can be found in all environments evaluated. Then the selection of strains carrying this kind of enzymes is due not only to clinic environments otherwise to all human environments. In the other hand, we have described two new betalactamase, CTX-M-14b and CTX-M-51, both deriving from CTX-M-9.<br/>The finding of strains carrying these enzymes in all the environments is of great concerning. We need not to select these strains, and to know what are the mechanisms of expansion of these enzymes. The epidemiologic study of the resistance mechanism is of great interest, not only in hospitals also in veterinarian environment, because knowing the prevalence and the type of enzymes, we can design specific antibiotic policy.