Identification of new LOXL2 substrates : a role for lysine oxidation in embryonic stem cell differentiation

dc.contributor
Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.contributor.author
Iturbide Martínez de Albéniz, Ane
dc.date.accessioned
2017-11-20T08:48:34Z
dc.date.available
2017-11-20T08:48:34Z
dc.date.issued
2016-03-15
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/10803/456678
dc.description.abstract
Protein function is often regulated and controlled by posttranslational modifications, such as oxidation. Although oxidation has been mainly considered to be uncontrolled and nonenzymatic, many enzymatic oxidations occur on enzyme-selected lysine residues; for instance, LOXL2 oxidizes lysines by converting the ε-amino groups into aldehyde groups. Using an unbiased proteomic approach, we have identified methylated TAF10, a member of the TFIID complex, as a LOXL2 substrate. LOXL2 oxidation of TAF10 induces its release from its promoters, leading to a block in TFIID-dependent gene transcription. In embryonic stem cells, this results in the inactivation of the pluripotency genes and loss of the pluripotent capacity. During zebrafish development, the absence of LOXL2 resulted in the aberrant overexpression of the neural progenitor gene Sox2 and impaired neural differentiation. Thus, lysine oxidation of the transcription factor TAF10 is a controlled protein modification and demonstrates a role for protein oxidation in regulating pluripotency genes
en_US
dc.description.abstract
La funció de les proteïnes és sovint regulada i controlada per modificacions post-traduccionals, com ara l’oxidació. Encara que l’oxidació ha sigut principalment considerada com una modificació incontrolada i no enzimàtica, moltes oxidacions tenen lloc en residus de lisina seleccionats enzimàticament: per exemple, LOXL2 oxida lisines convertint els grups ε-amino en grups aldehid. Mitjançant espectrometria de masses hem identificat el TAF10 metilat (membre del complex TFIID) com a substrat de LOXL2. L’oxidació de LOXL2 sobre TAF10 indueix la seva separació dels promotors, donant lloc a un bloqueig de la transcripció dels gens dependents de TFIID. En cèl•lules mare embrionàries, aquest efecte resulta en la inactivació dels gens de pluripotència i en la pèrdua de la capacitat pluripotent. La importància de la LOXL2 en la pèrdua d’aquest estat pluripotent queda reflexada en el desenvolupament del peix zebra, on la seva absència resulta en una sobreexpressió del gen marcador de progenitors neurals Sox2 i en la deterioració de la diferenciació neural. Per tant, l’oxidació de la lisina del factor de transcripció TAF10 és una modificació proteica controlada i demostra com l’oxidació de proteïnes pot exercir una funció en la regulació dels gens de pluripotència.
en_US
dc.format.extent
252 p.
en_US
dc.format.mimetype
application/pdf
dc.language.iso
eng
en_US
dc.publisher
Universitat Pompeu Fabra
dc.rights.license
ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.source
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject
Posttranslational modifications
en_US
dc.subject
Transcriptional regulation
en_US
dc.subject
Embryonic stem cells (ESCs)
en_US
dc.subject
LOXL2
en_US
dc.subject
TAF10
en_US
dc.subject
Modificacions post-traduccionals
en_US
dc.subject
Regulació de la transcripció
en_US
dc.subject
Cèl·lules mare embrionàries
en_US
dc.title
Identification of new LOXL2 substrates : a role for lysine oxidation in embryonic stem cell differentiation
en_US
dc.type
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.subject.udc
576
en_US
dc.contributor.authoremail
ane.iturbide@gmail.com
en_US
dc.contributor.director
Peiró Sales, Sandra
dc.contributor.director
García de Herreros, Antonio
dc.embargo.terms
cap
en_US
dc.rights.accessLevel
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.description.degree
Programa de doctorat en Biomedicina


Documents

taima.pdf

4.003Mb PDF

This item appears in the following Collection(s)