dc.contributor
Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.contributor.author
Di Giovanni, Francesca
dc.date.accessioned
2017-12-20T17:27:11Z
dc.date.available
2017-12-20T17:27:11Z
dc.date.issued
2016-11-24
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/10803/458452
dc.description.abstract
Chromatin is not randomly organized inside the eukaryotic nucleus in interphase. In
budding yeast gene expression of some specific loci is affected by their positioning in
the nucleus. Replication firing of early origins is also correlated to the position of the
respective ARSs (Autonomously Replicating Sequences) in the nucleus. However, the
relationship between nuclear positioning and DNA processes is not yet fully
understood.
To study the importance of chromosome positioning in nuclear processes and cell
physiology, we use budding yeast strains carrying fused chromosomes, which are
expected to dramatically change the chromosomes configuration in interphase. By
combining microscopy and computational modeling we show that the chromosomes
arrangement in strains carrying fused chromosomes is greatly modified. Despite the
reorganization of chromosomes in the nucleus, our functional experiments show that
transcriptional activity, replication timing and response to stress conditions are not
affected. The results, thus, indicate that the function of the genome is mostly
independent of chromosome positioning in the budding yeast nucleus.
en_US
dc.description.abstract
La cromatina no está distribuida de manera aleatoria dentro del núcleo eucariota en
interfase. En la levadura Saccharomyces cerevisiae la expresión de algunos genes
específicos depende de su posición en el núcleo. El inicio de los orígenes de replicación
está también correlacionado a la posición de las respectivas ARSs (Autonomously
Replicating Sequences) en el núcleo. Sin embargo, la relación entre posición nuclear y
los procesos del ADN no está completamente aclarado.
Para estudiar la importancia de la posición de los cromosomas en las actividades
nucleares y en la fisiología celular, hemos utilizado cepas de S. cerevisiae con fusiones
cromosómicas, en las que la conformación cromosómica típica de la levadura cambia
drásticamente. Mediante la combinación de la microscopía y de los modelos
computacionales mostramos que la organización cromosómica en las cepas que llevan
cromosomas fusionados está ampliamente modificada. Aunque la organización de los
cromosomas está modificada, nuestros experimentos funcionales muestran que la
actividad transcripcional, el tiempo de replicación y la respuesta a condiciones de estrés
no se muestran alterados. Por consiguiente, los resultados indican que la función del
genoma es principalmente independiente de la posición de los cromosomas en el núcleo
de la levadura Saccharomyces cerevisiae.
en_US
dc.format.extent
136 p.
en_US
dc.format.mimetype
application/pdf
dc.language.iso
eng
en_US
dc.publisher
Universitat Pompeu Fabra
dc.rights.license
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dc.source
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject
Genome organization
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dc.subject
DNA transcription
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dc.subject
DNA replication
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dc.subject
stress response
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dc.subject
translocations
en_US
dc.subject
Organización genómica
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dc.subject
transcripción del ADN
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dc.subject
replicación del ADN
en_US
dc.subject
respuesta a condiciones de estrés
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dc.subject
translocaciones
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dc.title
The impact of chromosome positioning in nuclear functions
en_US
dc.type
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.contributor.authoremail
francesca.digiovanni@crg.eu
en_US
dc.contributor.director
Marti-Renom, Marc A.
dc.contributor.director
Mendoza, Manuel (Mendoza Palomares),
dc.embargo.terms
cap
en_US
dc.rights.accessLevel
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.description.degree
Programa de doctorat en Biomedicina