Universitat Pompeu Fabra
Ruiz Trillo, Iñaki
2019-07-03
190 p.
Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
One of the main evolutionary transitions is the origin of animal and fungal multicellularity from single-cell ancestors. To address this change, it is necessary to study the extant unicellular relatives of animals (Metazoa) and fungi, all of them forming the Opisthokonta clade. Recent data have shown that adding more taxa to the Opisthokonta tree can dramatically change our view on this transition. However, the real diversity of these organisms is mostly unknown. Therefore, the main goal of this Ph.D. was to analyse the molecular diversity of both microbial opisthokonts as well as animals, searching for genetic novelty in the form of potential novel clades, as well as trying to better understand their ecology. Using Next-Generation Sequencing data, mainly metabarcoding based on the universal marker 18S rRNA gene, I have performed phylogenetic and ecological inferences, together with graph analysis, to unravel new undescribed diversity of Opisthokonta organisms.
Una de las principales transiciones evolutivas es el origen de la multicelularidad en animales y hongos a partir de sus ancestros unicelulares. Para entender este cambio es necesario estudiar a los organismos unicelulares más próximos evolutivamente a los animales (Metazoa) y hongos, formando todos ellos el clado Opisthokonta. Se ha comprobado que añadir información genética de más especies al árbol de los opistocontos puede cambiar drásticamente nuestra visión de dicha transición. Sin embargo, la diversidad real de estos linajes es prácticamente desconocida. Por tanto, el principal objetivo de este doctorado ha sido analizar la diversidad molecular de los opistocontos unicelulares y de animales para buscar novedad genética en forma de nuevos clados y, a la vez, entender su ecología. Usando datos de Secuenciación de Nueva Generación, principalmente metabarcoding del gen universal 18S rRNA, he realizado inferencias filogenéticas y ecológicas, junto con análisis de redes para descubrir nueva diversidad de organismos opistocontos desconocidos.
Molecular biodeversity; Opisthokonta; Metabarcoding; Prosits; Animals; Diversidad molecular; Opisthokonta; Metabarcoding; Protistas; Animales
575 - General genetics. General cytogenetics
ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
