Effect of light on nectarine-Monilinia spp. interaction and analysis of fungal and fruit responses during M. laxa infection

Abstract

La podridura marró és una important malaltia de la fruita de pinyol causada per diferents espècies de Monilinia. Aquest patogen pot infectar la fruita durant el seu creixement, però les principals pèrdues de fruita es produeixen durant el període de postcollita. El primer objectiu d'aquesta tesi va consistir en avaluar l'efecte de tractaments d'il·luminació durant el període d’emmagatzematge de postcollita en fruita embossada (fruita que s’havia embossat durant el període de creixement a camp) i fruita sense embossar, inoculades artificialment amb dues espècies de Monilinia (M. laxa i M. fructicola). A més, l'efecte d'aquests tractaments d'il·luminació també es va avaluar en el comportament de Monilinia spp. en nectarines, i en la qualitat global de nectarines embossades i sense embossar. El segon objectiu principal d’aquesta tesi va incloure un estudi d'interacció hoste-patogen, el qual va consistir en un anàlisi dual de seqüenciació d'ARN en dos estadis de desenvolupament de la nectarina que mostraven una susceptibilitat diferent a M. laxa. L’objectiu era destacar les estratègies globals desplegades tant pel fruit com pel patogen durant la seva interacció. També es va avaluar el paper d'alguns metabòlits secundaris (en concret, el metabolisme dels terpenoides i els compostos orgànics volàtils (COVs)) en teixits de nectarina que presentaven una susceptibilitat diferent a M. laxa mitjançant anàlisis d'expressió gènica i anàlisi del perfil de COVs, respectivament.

La podredumbre parda es una enfermedad importante en fruta de hueso que está causada por Monilinia spp. Este patógeno puede infectar a la fruta durante todo su crecimiento, aunque las principales pérdidas ocurren durante el periodo de postcosecha. El primer objetivo de esta tesis fue evaluar el efecto de tratamientos de iluminación durante el almacenamiento de postcosecha de nectarinas embolsadas y no embolsadas en precosecha, y artificialmente inoculadas con dos especies de Monilinia (M. laxa y M. fructicola). Además, el efecto de estos tratamientos también se evaluó sobre el comportamiento de Monilinia spp. en nectarinas y sobre la calidad global de nectarinas embolsadas y no embolsadas. El segundo objetivo principal incluía un estudio de interacción huésped-patógeno, el cual consistió en un análisis dual de secuenciación masiva del ARN en dos estadios del desarrollo de la nectarina con diferente susceptibilidad a M. laxa. También se evaluó el papel de algunos metabolitos secundarios (por ejemplo, los terpenoides y los compuestos orgánicos volátiles (COVs)) en tejidos de fruta con una susceptibilidad diferente a M. laxa, mediante análisis de expresión génica y análisis de los perfiles de COVs, respectivamente.

Brown rot is a significant disease in stone fruit caused by Monilinia spp. This pathogen can infect fruit during its growth, but the main fruit losses occur at the postharvest period. The first objective of this thesis was to evaluate the effect of lighting treatments along the postharvest storage on bagged (fruit that was bagged during preharvest) and unbagged fruit, which were artificially inoculated with two Monilinia species (M. laxa and M. fructicola). Besides, the effect of these lighting treatments was also evaluated on the behavior of Monilinia spp. on nectarines, and on the global quality of bagged and unbagged nectarines. The second main objective of this thesis covered the host-pathogen interaction, which consisted of a dual RNA-Sequencing analysis of two nectarine developmental stages that showed different susceptibility to M. laxa. The objective was to decipher the global strategies deployed by both the fruit and the pathogen during their interaction. A focus on the role of some secondary metabolites (i.e., terpenoid metabolism and volatile organic compounds (VOCs)) was also assessed in fruit tissues that presented different susceptibility to M. laxa through gene expression analyses and VOCs profile analyses, respectively.