Uncovering novel vulnerabilities of melanoma cells based on RNA regulation

Abstract

La tesi doctoral aquí presentada busca entendre quin és el paper de les proteïnes d’unió a l’ARN en la progressió tumoral, ja que s’ha demostrat que aquestes proteïnes poden regular aspectes que permeten o inhibeixen la progressió tumoral però encara no s’ha dut a terme un estudi sistemàtic per tal de trobar proteïnes d’unió a l’ARN implicades en càncer mesurant la seva activitat com a tal. Per adreçar-ho, hem identificat les proteïnes d’unió a l’ARN en tres línies cel·lulars de melanoma que presenten una agressivitat creixent. Mitjançant la comparació d’aquestes hem seleccionat 34 proteïnes que poden ser rellevants, les hem validat mitjançant 5 assajos funcionals en cèl·lules metastàtiques i n’hem estudiat una en detall.

The present doctoral thesis seeks to understand the role of RNA binding proteins (RBP) in tumoral progression, as there are demonstrations that these proteins can promote or inhibit tumoral progression, but no systematic and unbiased study has ever been performed in cancer measuring their RNA binding activity. To fill this gap, we have identified RBPs in three cell lines with increasing aggressiveness. By comparing them, we have selected 34 relevant RBPs, we have validated them in 5 functional assays in metastatic cells, and we have characterized one in detail.