Estudio del papel de la microbiota nasofaríngea en la gravedad de la infección por Rino/Enterovirus humano en niños menores de 5 años

Abstract

[spa] INTRODUCCIÓN: Los Rinovirus (RV) y Enterovirus (EV) son una de las principales causas de infección del tracto respiratorio superior (ITRS) e inferior (ITRI). Las manifestaciones clínicas producidas por los RV/EV son múltiples y heterogéneas, pudiendo causar desde infecciones asintomáticas hasta infecciones graves con compromiso vital. Esta variabilidad se ha relacionado con múltiples factores, dependientes del propio virus, del huésped o del ambiente. En los últimos años la microbiota nasofaríngea viral y bacteriana está cobrando protagonismo como un posible factor modulador de la gravedad de las infecciones respiratorias, pero existe poca evidencia acerca de su relación con la infección por RV/EV. HIPÓTESIS: La co-infección viral podría ser un factor modificador de la gravedad de la ITRI por RV/EV en niños menores de 5 años. Por otra parte, los niños menores de 5 años con ITRI grave por RV/EV podrían presentar una microbiota nasofaríngea bacteriana distinta a la de niños con infección respiratoria banal y niños sanos, en tanto que determinadas composiciones de microbiota nasofaríngea bacteriana se asociarían con salud respiratoria. En este sentido, la composición de la microbiota nasofaríngea bacteriana en el escenario de la infección por RV/EV variaría de acuerdo con la gravedad de los síntomas. OBJETIVOS: Describir el impacto clínico de la co-infección viral en pacientes con ITRI grave por RV/EV que precisan ingreso en una unidad de cuidados intensivos pediátricos (UCIP). Describir y comparar la microbiota nasofaríngea bacteriana de niños con ITRI grave por RV/EV, niños con infección respiratoria banal por estos microorganismos y niños sanos, identificando perfiles de microbiota bacteriana nasofaríngea relaciona- dos con salud respiratoria, y evaluando la relación de ésta con la gravedad de la infección por estos microorganismos.

MÉTODOS: Se realizaron dos estudios observacionales, en los que se reclutaron niños menores de 5 años atendidos en el hospital Sant Joan de Déu entre 2017-2020. En el primer estudio se incluyeron pacientes que precisaron ingreso en la UCIP de dicho centro, diagnosticados de ITRI por RV/EV mediante realización de un panel de PCR múltiple en aspirado nasofaríngeo, que era además capaz de detectar 6 virus respiratorios más. Se analizaron 3 grupos de pacientes en función de si presentaron mono-infección por RV/EV, co-infección con virus respiratorio sincitial (VRS), o co-infección con múltiples virus, considerando como variables resultado la necesidad de ventilación mecánica invasiva (VMI), y la estancia en UCIP superior a la media de la muestra (5 días). El segundo estudio con diseño caso-control se definieron 3 grupos: el grupo caso en el que se incluyeron niños con ITRI grave por RV/EV que precisaron ingreso en la UCIP, y que se pareó por rango de edad y sexo con dos grupos controles: niños sanos y niños con infección respiratoria banal por RV/EV. Se caracterizó la microbiota nasofaríngea bacteriana de estos 3 grupos mediante técnicas de secuenciación masiva basadas en la tecnología del gen 16S rRNA. PRINCIPALES RESULTADOS: En la presente tesis se ha identificado que la co-infección de RV/EV con múltiples virus respiratorios no representa un factor que incremente la gravedad de dicha infección. Los pacientes que presentaron una ITRI grave por RV/EV en mono-infección precisaron VMI y tuvieron una estancia media en UCIP significativamente mayor que los pacientes con múltiples co-infecciones. Por otra parte, se han descrito diferentes perfiles de microbiota nasofaríngea bacteriana en función de la presentación clínica de la infección por RV/EV. Los niños sanos presentaron una microbiota nasofaríngea rica y diversa, con mayor abundancia de especies comensales como Dolosigranulum pigrum y Corynebacterium spp. En cambio, los niños con ITRI grave por RV/EV presentaron una microbiota nasofaríngea significativamente menos rica y diversa que los controles sanos, con una menor abundancia de Dolosigranulum y una mayor abundancia de Haemophilus. Los niños con infección respiratoria banal RV/EV mostraron niveles intermedios de riqueza y diversidad entre ambos grupos.

CONCLUSIONES: Los RV/EV en mono-infección pueden constituir el agente etiológico de ITRI grave en el paciente pediátrico. La co-infección con otros virus respiratorios no resulta un factor determinante que incremente la gravedad de las ITRI por RV/EV. Se han caracterizado diferentes perfiles de microbiota nasofaríngea bacteriana en función de la gravedad de las manifestaciones clínicas de la infección por RV/EV, con una disbiosis progresiva de dicha microbiota desde la que presentan los pacientes asintomáticos hasta la descrita en aquellos que precisaron ingreso en la UCIP, caracterizada por una pérdida de riqueza y diversidad, reducción de bacterias comensales como Dolosigranulum y aumento de bacterias del género Haemophilus.