Systems biology perspectives on cellular senescence and inflammation

Author

Sabalic, Alda ORCID

Director

García Ojalvo, Jordi ORCID

Date of defense

2024-06-21

Pages

120 p.



Department/Institute

Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida

Doctorate programs

Programa de Doctorat en Biomedicina

Abstract

This thesis examines inflammation from the perspective of systems biology in two different situations: cellular senescence resulting from unresolved tissue damage and the acute immune response to the invasion of a pathogen, particularly influenza A infection. Cellular senescence, a process marked by halted cell proliferation and inflammation, was explored through network analysis techniques, revealing key genes and their roles in senescence pathways and offering possible molecular hallmarks of senescence. In turn, the immune response to viral infection was studied from the point of view of the digital nature of interferon release and its role in acute inflammation. By investigating both individual and collective cellular behaviors, this thesis provides insights into the spatiotemporal dynamics of inflammation in mammalian tissues, the propagation of infection in cellular populations, and the antiviral response of mammalian cells. Overall, this research contributes to understanding inflammation dynamics within tissues, laying a foundation for future studies on inflammation-related disorders and disease management strategies.


En esta tesis exploramos la inflamación desde dos perspectivas: la senescencia celular, consecuencia del daño tisular, y la respuesta inmune aguda ante la invasión patógena, especialmente por la influenza A. La senescencia celular fue estudiada mediante técnicas de análisis de redes, identificando genes clave y sus funciones en las vías de la senescencia, así como posibles marcadores moleculares. Además, se examinó la respuesta inmune ante la infección viral, resaltando la naturaleza digital de la secreción de interferón y su impacto en la inflamación. Finalmente, este estudio brinda valiosos descubrimientos sobre la dinámica espacio-temporal de la inflamación, la propagación de la infección y la respuesta antiviral, ofreciendo las bases para futuras investigaciones sobre trastornos inflamatorios y estrategias de manejo de enfermedades.

Keywords

Cellular senescence; Inflammation; Systems biology; Inflamación; Senescencia; Biología de sistemas

Subjects

576 - Cellular and subcellular biology. Cytology

Documents

tas.pdf

17.00Mb

 

Rights

ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.

This item appears in the following Collection(s)