Design and implementation of a next-generation sequencing test for the fast and cost-effective SARS-CoV-2 differantial diagnosis and variant detection

dc.contributor
Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida
dc.contributor.author
Montero Vale, María Mercedes
dc.date.accessioned
2024-09-20T13:42:38Z
dc.date.available
2024-09-20T13:42:38Z
dc.date.issued
2024-09-13
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/10803/692226
dc.description.abstract
In the beginning of 2020 the WHO declared a pandemic that was initiated by the outbreak of a new virus named as severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) that quickly spread globally, challenging our society and turning it upside down in ways we did not anticipate. The continuous emergence of new SARS-CoV-2 variants together with the compatibility of the coronavirus disease (COVID-19) symptomatology with other viral respiratory infections revealed the need of developing more specific tools than the methods that were widely implemented throughout the pandemic. This thesis presents a novel next generation sequencing (NGS) based testing strategy that aims to differentially diagnose SARS-CoV-2 virus and its variants, as well as other respiratory viruses in order to overcome the limitations of the existing testing methods.
ca
dc.description.abstract
A principios del año 2020 la Organización Mundial de la Salud (OMS) declaró una pandemia que fue iniciada por un brote de un nuevo virus denominado como Coronavirus 2 del Síndrome Respiratorio Agudo Severo (SARS-CoV-2) que rápidamente se expandió de manera global, poniendo a prueba nuestra sociedad de un modo que no habríamos imaginado. La continua aparición de nuevas variantes de SARS-CoV-2 junto con la compatibilidad de la sintomagología de la enfermedad por coronavirus (COVID-19) con otras infecciones respiratorias de causa viral demostró la necesidad de desarrollar herramientas de diagnóstico más específicas que los métodos que fueron implementados durante la pandemia. Esta tesis presenta una nueva estrategia de diagnóstico basada en herramientas de secuenciación masiva de nueva generación (NGS) que pretende diagnosticar de manera diferencial SARS-CoV-2 y sus variantes, así como otros virus respiratorios con el fin de vencer las limitaciones de los métodos de diagnóstico que existen actualmente de una manera coste-eficiente.
ca
dc.format.extent
280 p.
ca
dc.language.iso
eng
ca
dc.publisher
Universitat Pompeu Fabra
dc.rights.license
ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
ca
dc.source
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject
Pandemic
ca
dc.subject
SARS-CoV-2
ca
dc.subject
NGS
ca
dc.subject
RNA sequencing
ca
dc.subject
Differential diagnosis
ca
dc.subject
Respiratory viruses
ca
dc.subject
Pandemia
ca
dc.subject
Diagnóstico diferencial
ca
dc.subject
Virus respiratorios
ca
dc.title
Design and implementation of a next-generation sequencing test for the fast and cost-effective SARS-CoV-2 differantial diagnosis and variant detection
ca
dc.type
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.subject.udc
578
ca
dc.contributor.authoremail
mamercedesmontero@gmail.com
ca
dc.contributor.director
Rodríguez Lumbiarres, Jairo
dc.contributor.director
González Ruiz, Juan Ramón
dc.embargo.terms
cap
ca
dc.rights.accessLevel
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.description.degree
Programa de Doctorat en Biomedicina


Documentos

tmmmv.pdf

11.52Mb PDF

Este ítem aparece en la(s) siguiente(s) colección(ones)