Analysis of genetic variation in microrna-mediated regulation and the susceptibility to anxiety disorders

dc.contributor
Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.contributor.author
Muiños Gimeno, Margarita
dc.date.accessioned
2011-04-12T16:29:27Z
dc.date.available
2010-02-11
dc.date.issued
2009-12-18
dc.date.submitted
2010-02-11
dc.identifier.isbn
9788469307540
dc.identifier.uri
http://www.tdx.cat/TDX-0211110-134946
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/10803/7192
dc.description.abstract
We have investigated genetic variation in microRNA-mediated regulation as a susceptibility factor for anxiety disorders following two different approaches. We first studied two isoforms of the candidate gene NTRK3 by re-sequencing its different 3'UTRs in patients with Panic (PD) and Obsessive Compulsive disorders (OCD) as well as controls. Two rare variants that altered microRNA-mediated regulation were identified in PD. Conversely, association of a common SNP with OCD hoarding subtype was found. Moreover, we have also studied a possible involvement of microRNAs in anxiety disorders. Consequently, we have analysed the genomic organisation and genetic variation of miRNA-containing regions to construct a panel of SNPs for association analysis. Case-control studies revealed several associations. However, it is worth remarking the associations of miR-22 and miR-488 with PD; two microRNAs for which functional assays and transcriptome analysis after microRNA overexpression showed significant repression of a subset of genes involved in physiological pathways linked to PD development.
dc.description.abstract
Hem investigat la variació genètica a la regulació mediada per microRNAs com a factors de susceptibilitat pels trastorns d'ansietat seguint dues aproximacions diferents. Primer vam estudiar dues isoformes del gen candidat NTRK3 mitjançant la reseqüenciació dels seus diferents 3'UTRs a pacients de pànic (TP), a pacients amb trastorn obsessiu compulsiu (TOC) i a controls. Dues variants rares que alteren la regulació mediada per microRNAs foren identificades per TP. D'altra banda, es trobà associació d'un SNP comú amb el subtipus acumulador de TOC. A més, també hem estudiat la possible implicació dels microRNAs als trastorns d'ansietat. Conseqüentment, hem analitzat l'organització genòmica i la variació genètica a regions que contenen microRNAs per construir un panell d'SNPs per fer anàlisis d'associació. Els estudis cas-control van revelar algunes associacions. Tanmateix, val la pena destacar les associacions del miR-22 i el miR-488 amb TP; dos microRNAs pels quals assajos funcionals i anàlisis de transcriptoma després de la seva sobreexpressió han mostrat una repressió significativa d'un grup de gens implicats en vies fisiològiques lligades al desenvolupament del TP.
dc.format.mimetype
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Universitat Pompeu Fabra
dc.rights.license
ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.source
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject
isoforma
dc.subject
anàlisi de transcriptoma
dc.subject
PCR
dc.subject
assaig de luciferasa
dc.subject
variant comuna
dc.subject
variant rara
dc.subject
reseqüenciar
dc.subject
estudis d'associació
dc.subject
poly-miRTS
dc.subject
trastorn obsessiu-compulsiu
dc.subject
trastorn de pànic
dc.subject
trastorn d'ansietat
dc.subject
variació genètica intraespecífica
dc.subject
SNP
dc.subject
NTRK3
dc.subject
gen candidat
dc.subject
element regulador
dc.subject
microRNA
dc.subject
variació genòmica
dc.subject
desordres poligènics
dc.subject
trets complexes
dc.subject
isoform
dc.subject
transcriptome analysis
dc.subject
PCR
dc.subject
luciferase assay
dc.subject
common variant
dc.subject
rare variant
dc.subject
re-sequencing
dc.subject
association studies
dc.subject
poly-miRTS
dc.subject
obsessive-compulsive disorder
dc.subject
panic disorder
dc.subject
anxiety disorder
dc.subject
genetic variation within species
dc.subject
SNP
dc.subject
NTRK3
dc.subject
candidate gene
dc.subject
regulatory element
dc.subject
microRNA
dc.subject
genome variation
dc.subject
polygenic disorders
dc.subject
complex traits
dc.title
Analysis of genetic variation in microrna-mediated regulation and the susceptibility to anxiety disorders
dc.type
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.subject.udc
575
dc.contributor.director
Espinosa Parrilla, Yolanda
dc.rights.accessLevel
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.identifier.dl
B.8788-2010
dc.description.degree
Programa de doctorat en Biomedicina


Documents

tmmg.pdf.pdf

8.776Mb PDF

Aquest element apareix en la col·lecció o col·leccions següent(s)