Biochemoinformatics: integrative computational tools at the interface between chemistry and biology

dc.contributor
Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.contributor.author
García Serna, Ricard
dc.date.accessioned
2011-04-12T16:30:06Z
dc.date.available
2011-02-08
dc.date.issued
2010-09-27
dc.date.submitted
2011-02-08
dc.identifier.isbn
978-84-694-2118-5
dc.identifier.uri
http://www.tdx.cat/TDX-0208111-124718
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/10803/7225
dc.description.abstract
The work on this thesis has focused on the development of integrated databases and visualization tools for three related areas of biomedical sciences involved in the drug discovery process. An annotated chemical library including drugs and other bioactive compounds with reported affinities over protein targets has been extended and optimized for its use in different knowledge based analysis and virtual profiling methodologies. A second database relating drugs with their side effects has also been developed in preparation for future studies. At the same time, two web based visualization architectures have been designed and implemented as tools for the analysis of relevant data.
dc.description.abstract
Aquesta tesi ha comprès el desenvolupament de bases de dades i eines de visualització relacionades amb tres àrees de la biomedicina implicades en el procés de disseny de fàrmacs. S'ha estès i optimitzat una llibreria química que inclou fàrmacs i altres compostos bioactius anotats a proteïnes diana pel seu ús en diferents anàlisis i metodologies de perfilat virtual. També s'ha desenvolupat una segona base de dades relacionant fàrmacs comercialitzats amb els seus efectes adversos com a base per a futurs estudis. A l'hora han estat dissenyades i implementades dues eines web de visualització d'informació rellevant en aquest camp.
dc.format.mimetype
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Universitat Pompeu Fabra
dc.rights.license
ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.source
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject
toxicogenòmica
dc.subject
proteòmica
dc.subject
farmacologia
dc.subject
medicaments disseny
dc.subject
quimioinformàtica
dc.subject
quimiogenòmica
dc.subject
toxicogenomics
dc.subject
proteomics
dc.subject
pharmacology
dc.subject
drug design
dc.subject
Chemoinformatics
dc.subject
Chemogenomics
dc.title
Biochemoinformatics: integrative computational tools at the interface between chemistry and biology
dc.type
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.subject.udc
573
dc.contributor.authoremail
ricard.garcia@chemotargets.com
dc.contributor.director
Mestres i López, Jordi
dc.rights.accessLevel
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.identifier.dl
B.7626-2011
dc.description.degree
Programa de doctorat en Biomedicina


Documentos

trgs.pdf

2.921Mb PDF

Este ítem aparece en la(s) siguiente(s) colección(ones)