Taxonomía de los hongos ascomicetos del suelo.

Abstract

En los últimos 20 años los compuestos obtenidos a partir de los hongos se incrementaron en un 77%. La mayor parte de las especies fúngicas productoras de nuevos metabolitos fueron aisladas del suelo. El primer paso en la investigación de sustancias biológicamente activas producidas por hongos es la recolecta amplia de estos organismos, su aislamiento, clasificación y conservación. <br/>El suelo es uno de los principales reservorios de propágalos fúngicos, pero los ascomicetos de suelo permanecen en forma de esporas latentes, por tanto para obtener cultivos puros es necesaria la interrupción de éste estadio. Por esta razón uno de nuestros principales objetivos fue utilizar diferentes técnicas de activación de ascosporas latentes.<br/><br/>Por otra parte, la clasificación de los ascomicetos ha estado basada tradicionalmente en criterios morfológicos. Sin embargo, numerosas publicaciones demuestran que un sistema taxonómico basado únicamente en este tipo de caracteres no tiene correlación con las relaciones filogenéticas inferidas a partir del análisis del ADN. En este sentido nos propusimos estudiar morfológica y genéticamente las relaciones entre los géneros Gelasinospora y Neurospora, además de delimitar las relaciones entre los géneros incluidos en la familia Coniochaetaceae.<br/><br/>En este trabajo se analizaron más de 1500 muestras de suelo. Los métodos escogidos para la activación de las ascosporas latentes fueron los basados en la acción del ácido acético, del etanol y del fenol, así como la aplicación de métodos indirectos de aislamientos, utilizando la técnica de cebo o anzuelo.<br/><br/> <br/>A través de la activación por acción del fenol y del etanol se aislaron cinco taxones nuevos:<br/><br/>· Apiosordaria globosa,<br/>· Apiosordaria hispanica,<br/>· Neurospora nigeriensis,<br/>· Neurospora uniporata y<br/>· Poroconiochaeta tetraspora.<br/><br/>La aplicación de la técnica de aislamiento indirecto, utilizando un fragmento de madera seca como cebo, nos permitió describir cinco taxones nuevos; el género nuevo Coronatomyces y las especies nuevas: <br/><br/>· Coronatomyces cubensis, <br/>· Sphaerodes quadrangularis, <br/>· Sphaerodes tenuísima y <br/>· Syspastospora tropicales. <br/><br/>Además, se proponen 3 combinaciones nuevas para el género Sphaerodes y se presenta una clave dicotómica para las especies aceptadas en el género.<br/><br/>Los géneros Gelasinospora y Neurospora se han distinguido tradicionalmente por el patrón de ornamentación de sus ascosporas. Sin embargo el examen detallado de la morfología de numerosos aislamientos y un estudio filogenético basado en la secuencia parcial del gen 28S ARNr de 27 especies de ambos géneros demostraron:<br/><br/>1. que ambos géneros forman un grupo monofilético,<br/>2. que el patrón de ornamentación de las ascosporas carece de valor taxonómico y<br/>3. que la morfología del episporio es un carácter de valor filogenético. <br/><br/>En consecuencia los géneros Neurospora y Gelasinospora son sinonimizados. La diagnosis genérica de Neurospora es enmendada y se proponen 36 combinaciones nuevas para el género. Incluimos la sinopsis y la clave para identificar las 49 especies que hasta el momento se circunscriben en el género. Se describe el nuevo género Pseudoneurospora para reubicar a P. amorphoporcata (syn. Gelasinospora amorphoporcata comb. nov.).<br/><br/>Con el objetivo de dilucidar las relaciones filogenéticas entre los géneros incluidos en la familia Coniochaetaceae se realizó un análisis de las secuencias parciales de los genes 18S y 28S del ARNr. Los árboles filogenéticos obtenidos no sustentan la monofilia de los géneros Coniochaeta, Coniochaetidium, Ephemeroascus y Proroconiochaeta. El estudio morfológico confirma que no existen suficientes diferencias que permitan distinguirlos, por lo que estos tres últimos géneros son tratados como sinónimos de Coniochaeta. Se revisa la circunscripción de Coniochaeta y se proponen 9 combinaciones nuevas. Proponemos 3 géneros nuevos en el orden Xylariales: Coniocessia, Pseudorosellinia y Novaxylaria para reubicar las especies Coniochaeta nodulisporioides, Coniochaeta emodensis y Coniolaria murandii, respectivamente. Se discute la posición taxonómica de los géneros Synaptospora y Wallrothiella dentro del orden Coniochaetales.

In the last 20 years the compounds obtained from fungi were increased up to 77%, and main of these species of fungi which producing new metabolites were isolated from soil. The first step in the investigation of substances biologically active produced by fungi is collects a profuse diversity of these organisms, their isolation, classification and conservation. <br/>The soil is one of the major reservoir of fungal propagules; but soil ascomycetes may remain in dormant spores phase, so is necessary the disruptions of this stage to obtain pure cultures. Therefore one of our main objectives was to use different activation techniques of dormant ascospores. <br/><br/>In other hand, classification of the ascomycetes has been traditionally based on morphological criteria. However, numerous recent studies have demonstrated that a taxonomic classification based only on morphological characters frequently does not correlate with the phylogenetic relationships inferred from DNA sequences. In this way the mains aims of this study was to evaluate the morphological and genetic relationships between Gelasinospora and Neurospora and also to delimitate the relationships among the genera recognized in the family Coniochaetaceae.<br/><br/>In this work more than 1500 soil samples were analyzed. The methods selected for the activation of the dormant ascospores were those based on the action of acetic acid, ethanol and phenol.<br/><br/> <br/>Through the activation by the action of phenol and by ethanol five new taxa were isolated: <br/><br/>· Apiosordaria globosa, <br/>· Apiosordaria hispanica,<br/>· Neurospora nigeriensis, <br/>· Neurospora uniporata and<br/>· Poroconiochaeta tetraspora.<br/><br/>The application of soil bait technique (indirect isolation method) using a dry wood fragment like bait, allowed to us to described five new taxa; the new genus Coronatomyces and the new species: <br/><br/>· Coronatomyces cubensis, <br/>· Sphaerodes quadrangularis, <br/>· Sphaerodes tenuissima and <br/>· Syspastospora tropicalis. <br/><br/>In addition, three new combinations are proposed for the genus Sphaerodes, and a key to the accepted species of the genus is provided.<br/><br/>Neurospora and Gelasinospora are traditionally distinguished by the ornamentation pattern of their ascospores. However, a detailed examination of the morphology of numerous strains and the phylogenetic study based on partial sequences of the 28S rDNA gene from 27 species of both genera demonstrate:<br/><br/>1. that both genera form a monophyletic group, <br/>2. that the ornamentation pattern of the ascospores wall is not an useful criterion and <br/>3. that the morphology of the episporial-layer of the ascospores is a very informative character. <br/><br/>Consequently the names Neurospora and Gelasinospora were synonymized. Generic diagnosis of Neurospora is amended and 36 new combinations are proposed. A synopsis and a key to the 49 species of Neurospora now recognized in the genus are presented. Furthermore, the new genus Pseudoneurospora is described to accommodate P. amorphoporcata (syn. Gelasinospora amorphoporcata comb. nov.).<br/><br/>In order to clarify the phylogenetic relationships of genera in the Coniochaetaceae we performed a molecular study based on the analyses of the sequences of the partial 18S and 28S rADN genes. The phylogenetic trees obtained do not support the monophyly of the genera Coniochaeta, Coniochaetidium, Ephemeroascus and Poroconiochaeta. A morphological study confirmed that there were not enough differences to distinguish these genera, and the latter three are treated as synonyms of Coniochaeta. The circumscription of the genus Coniochaeta is revised and 9 new combinations are proposed. The genera Coniocessia, Pseudorosellinia, and Novaxylaria are proposed as new within the order Xylariales to accommodate Coniochaeta nodulisporioides, Coniochaeta emodensis, and Coniolaria murandii, respectively. The taxonomic positions of Synaptospora and Wallrothiella within Coniochaetales are also discussed.