dc.contributor
Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.contributor.author
Pich Roselló, Oriol
dc.date.accessioned
2021-04-30T14:40:50Z
dc.date.available
2021-04-30T14:40:50Z
dc.date.issued
2021-03-24
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/10803/671532
dc.description.abstract
Cells of our body are constantly exposed to events that can create lesions in the
DNA. If unremoved by the DNA repair mechanisms, the lesion may lead to a
mutational event. Some of these events might drive the transformation of a healthy
cell to a malignant one. This thesis focuses on understanding the generation of
mutations and their positive selection in somatic tissues. First, we study the coding
and noncoding driver landscape of more than 2500 patients. We also attempt to
distinguish driver and passenger mutations in driver genes, and link them to
mutational processes. We then study the mutations related to chemotherapies in
both tumoral and healthy cells, as well as the effects of treatment in clonal
hematopoiesis (CH). We also perform a systematic discovery of CH driver genes.
Lastly, we study the interplay of DNA damage and repair in nucleosome-bound DNA,
uncovering a 10bp periodic mutation rate which might have influenced the genome
composition in eukarya.
en_US
dc.description.abstract
Les cèl·lules del nostre cos estan constantment exposades a esdeveniments que
poden lesionar l’ADN. Si aquestes lesions no són eliminades pels mecanismes de
reparació, poden causar mutacions. Alguns d’aquests podrien ajudar a transformar
una cèl·lula sana en una maligna. Aquesta tesi doctoral té com objectiu estudiar la
generació de les mutacions i com són seleccionades positivament als teixits
somàtics. Primer, estudiem el panorama de drivers en zones codificant i no
codificant en més de 2500 pacients. També intentem distingir quines mutacions són
driver de les passenger, i les relacionem amb els processos mutacionals. Després
estudiem les mutacions relacionades amb la quimioteràpia en cèl·lules sanes i
tumorals, i també l’efecte que tenen a la hematopoesi clonal. D’aquest últim
fenomen en descobrim els gens drivers. Per últim, estudiem la relació entre el dany
a l’ADN i els mecanismes de reparació quan la molècula s’empaqueta en
nucleosomes. Aquesta relació deixa una periodicitat de 10 parells de bases que pot
haver influenciat la composició del genoma dels eucariotes.
en_US
dc.format.extent
330 p.
en_US
dc.format.mimetype
application/pdf
dc.language.iso
eng
en_US
dc.rights.license
ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.source
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject
Genomics
en_US
dc.subject
Evolution
en_US
dc.subject
Chemotherapy
en_US
dc.subject
Mutational processes càncer
en_US
dc.subject
Genòmica
en_US
dc.subject
Evolució
en_US
dc.subject
Quimioteràpia
en_US
dc.subject
Processos mutacionals
en_US
dc.title
The Role of mutational processes in the evolution of somatic tissues and malignancy
en_US
dc.type
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.contributor.authoremail
oriol.pich@irbbarcelona.org
en_US
dc.contributor.director
López Bigas, Núria
dc.contributor.director
González-Pérez, Abel
dc.embargo.terms
cap
en_US
dc.rights.accessLevel
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.description.degree
Programa de doctorat en Biomedicina