Phylogenomic insights into the evolution of subterranean Coleoptera

Autor/a

Balart i García, Pau

Director/a

Fernández, Rosa

Ribera Galán, Ignacio

Data de defensa

2023-02-24

Pàgines

188 p.



Departament/Institut

Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida

Programa de doctorat

Programa de doctorat en Biomedicina

Resum

Under very specific pressures, evolution turns extremely convergent, to the extent that distantly-related organisms show highly similar morphological, physiological and behavioral adaptations. Life into the perpetual darkness of caves is an obvious case of convergent evolution, epitomized by loss of vision among other common phenotypes. In compensation, extra-optic sensory systems are modified in order to perceive essential information from the environment. This doctoral thesis explores the genomic basis of subterranean adaptations and their evolution, characterizing and comparing the gene repertoire of different Coleoptera lineages. These study systems represent phylogenetically-distinct replicas of evolution underground, both in aquatic and terrestrial habitats. The evolution of the chemosensory system will be the principal object of study, nevertheless, genome-wide comparisons between surface-dwelling and subterranean species that belong to independent lineages will also shed light into the origin of the subterranean phenotype and the extent of parallel and convergent evolution in cave-dwelling beetles.


Sota pressions molt específiques, l'evolució resulta extremadament convergent, fins al punt que organismes poc relacionats mostren adaptacions morfològiques, fisiològiques i comportamentals molt similars. La vida a la foscor perpètua de les coves és un cas evident d'evolució convergent, personificada per la pèrdua de visió entre altres fenotips comuns. Com a compensació, els sistemes sensorials extra-òptics experimenten modificacions per tal de percebre la informació essencial de l’ambient. Aquesta tesi doctoral explora les bases genòmiques d’adaptacions subterrànies i la seva evolució, caracteritzant i comparant el repertori genètic de diferents llinatges de coleòpters. Aquests sistemes d’estudi representen rèpliques filogenèticament diferenciades de l'evolució sota terra, tant en hàbitats aquàtics com terrestres. L'evolució del sistema quimiosensorial serà el principal objecte d'estudi, no obstant, mitjançant comparacions a tot el genoma entre especies superficials i subterrànies que pertanyen a llinatges independents també s’aclarirà l'origen del fenotip subterrani i l'extensió del evolució paral·lela i convergent en escarabats cavernícoles.

Paraules clau

Evolution; Subterranean biology; Phylogenomics; Gene repertoire; Chemosensory system; Evolutionary convergence; Transcriptomes; Exaptation; Adaptation; Coleoptera; Evolució; Biologia subterrània; Filogenómica; Repertori genètic; Sistema quimiosensorial; Convergència evolutiva; Transcriptomes; Exaptació; Adaptació; Coleoptera

Matèries

575 - Genètica general. Citogenètica general. Immunogenètica. Evolució. Filogènia

Documents

tpbg.pdf

73.96Mb

 

Drets

ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.

Aquest element apareix en la col·lecció o col·leccions següent(s)